一、内部控制制度评价

内部控制制度是事业单位内部管理的重要组成部分，是事业单位内部为实现组织目标，确保财产物资的安全、完整，财务信息的真实、合法，各项经济活动的合规、合法及效益性，利用内部因分工不同而产生的相互联系，相互制约的机制，建立起来的一系列内部管理制度。内部控制制度评价，是事业领导干部经济责任审计的重要环节，通过评价，向事业单位及主管部门提出加强管理和促进控制措施的建议。

从审计评价的角度看，事业单位内部控制制度，一般分为内部会计控制和内部管理控制两大部分。内部会计控制制度主要内容有授权批准控制、财务收支计划控制、职务分离控制、会计记录控制、实物控制等方面。内部管理制度主要内容有管理组织机构设置、年度工作计划、组织人事控制等方面。内部控制制度的评价，就是对其是否健全，有效进行的审查和评价。一般分为健全性评价和符合性评价两个步骤，其方法与其他行业基本相同。

二、事业单位资产和负债审计

事业单位资产审计，主要内容依然是审查现金，银行存款，应收及预付款项，存货，对外投资，固定资产，无形资产的真实性、合法性，负债审计也是主要包括借入款项，应付账款其他应付款，各种应缴款项等的审计。其方法，程序与一般企业的审计相差不多。

三、事业单位净资产审计

事业单位的净资产是指基金资产减去基金负债后的差额。包括事业基金、固定基金、专用基金、结余等。

1、事业基金审计：事业基金是指事业单位拥有的非限定用途的净资产，主要包括滚存结余资金等。按当期实际发生数记账。对事业基金的审计，主要包括以下内容：

（1）、审查事业基金来源的合法性。主要审查事业单位的事业基金来源是否为滚存结余资金和一般投资基金，有无将不应转入事业基金的其他基金记入该科目的问题。

（2）、审查事业基金期末余额的真实性。主要将事业基金总账、明细账、记账凭证、原始凭证核对，看是否一致;再将事业基金总账与资产负债表上反映的数字核对，看是否相符，有无不一致的地方。

（3）、审查事业基金账务处理的正确性。

2、固定基金审计。固定基金是指固定资产占用的基金。固定基金应按实际发生额记账。对固定基金的审计，主要包括以下内容：

（1）、审查固定基金来源的合法性。主要审查有关原始凭证，看事业单位固定基金来源是否为其购入、自制、调入、融资租入、接受捐赠和盘盈固定资产所形成的基金，有无将不应该记入固定基金和其他用途的基金记入该账户的问题。

（2）、审查固定基金账面余额的真实性。将固定基金账与记账凭证、原始凭证核对，看是否相符;再将固定基金账与资产负债表上反映的数字核对，看是否相符。

（3）、审查固定基金的账务处理是否正确。

3、专用基金审计。

专用基金是指事业单位按规定提取、设置专门用途的基金，主要包括修购基金、职工福利基金、医疗基金以及其他基金等。专用基金增加应按当期实际提取转入的数额记账;减少应按当期实际支出数额记账。对专用基金的审计，主要包括以下内容：

（1）、审查专用基金来源的合规性。主要审查专用基金原始凭证，看事业单位的修购基金是否按事业收入和经营收入的一定比例提取和按其他规定提取转入;职工福利基金是否按结余的一定比例提取和按其他规定提取转入;医疗基金是否按当地财政部门规定的公费医疗经费开支标准从收入中提取;其他基金会来源是否合法。

（2）、审查专用基金期末账户余额的真实性。将专用基金总账、明细账与记账凭证、原始凭证核对，看是否一致;再将专用基金总账与资产负债表上的数字核对，看是否相符，有无不一致的情况。

（3）、审查专用基金使用的合法性。主要审查修购基金是否在修缮费和设备购置费中各列支50%,是否全部用于事业单位固定资产维修和购置方面;职工福利基金是否全部用于单位职工的集体福利设施、集体福利待遇等;医疗基金是否全部用于单位职工的医疗开支。

（4）、审查专用基金账务处理的正确性。

四、其他内容审计

除以上事业基金，固定基金、专用基金的审计外，还有事业结余、经营结余、结余分配等内容的审计，具体的科目有：事业收入、财政补助收入、上级补助收入、附属单位缴款，经营收入、经营支出、销售税金等科目，在具体审计中，应审查各账户期末余额的真实性，各账户账务处理的正确等方面，方法同上文提及的。审查各账户的各种鉴证记录以及相关账户，相关业务，收入类账户，还应审查其确认是否符合从事业单位会计准则的要求。其取得是否合法;支出类账户，还应审查其支出是否合法、合规;其归集是否符合事业单位财务会计制度的要求。