1、主体不同。公司合并是公司间的行为，主体是参加合并的各公司。公司合并要由参加合并的各公司作出决议，要有合并各方公司签订协议。股权收购是收购公司与目标公司的股东之间的交易行为，主体是收购公司与目标公司股东。2、效力不同。公司合并的效力使公司实体发生变化，吸收合并中，被吸收的公司解散，丧失法律人格，并入存续公司。新设合并中，各方都解散，丧失法律人格，新设公司取代合并各公司。收购的效力使目标公司控股股东发生变化，目标公司本身不发生变化，依然存续。收购方成为目标公司的唯一股东，目标公司作为收购方的全资子公司而存在。3、权利义务的承担不同。公司合并中解散公司的权利义务由合并后存续公司和新设公司承担，公司收购中，目标公司本身未发生变化，并未丧失法律人格，其权利义务由目标公司自身承担。4、控制程度不同。公司合并中，被并公司完全并入存续公司或新设公司，后者取得被并公司的全部财产、权利义务，被并公司作为存续公司、新设公司的一部分而完全受其控制。股权收购中，收购方既可以收购目标公司的全部股份，进而完全控制目标公司，也可以只收购的目标公司50％以上的股份，而取得对目标公司的控制权，实现拥有控制权下的合资经营。5、程序和法律适用也不同。

如何区分公司合并收购、兼并与并购

一、合并

所谓合并是指两个或两个以上的公司，依照公司法规定的条件和程序，通过订立合并协议，共同组成一个公司的法律行为。具体包括吸收合并（merger）与新设合并（consolidation）两种。

二、收购

收购（acqisition）通常是指一个公司通过产权交易取得另一家公司一定程度的控制权。具体来讲，依据划分的标准不同，可以分为横向收购、纵向收购与混合收购等多种类型。

三、兼并

兼并，则情况比较复杂。因为在我国公司法中，并没有明确界定这一词汇，并且在实践中常常出现混用的情况。因此，对于它是不是一个法律概念的问题争议很多。在我国，兼并有时与吸收合并同义，有时又与收购相同。具体来说，目前企业兼并的主要形式包括：

1．承担债务式兼并；

2．购买式兼并；

3．吸收股份式兼并；

4．控股式兼并。

四、并购

并购的涵义则更为广泛。它是指涉及目标公司控股权转移的各种产权交易形式的总称。因此企业并购的过程实质上是企业权利主体不断变换的过程。兼并与并购两者相较，仅仅是语意表达的侧重点有所不同，前者强调行为，而后者更重结果。并且两者都是经济学词汇，而非严格意义上的法律术语。

我国《公司法》规定：

第一百七十三条

公司合并，应当由合并各方签订合并协议，并编制资产负债表及财产清单。公司应当自作出合并决议之日起十日内通知债权人，并于三十日内在报纸上公告。债权人自接到通知书之日起三十日内，未接到通知书的自公告之日起四十五日内，可以要求公司清偿债务或者提供相应的担保。

第一百七十四条

公司合并时，合并各方的债权、债务，应当由合并后存续的公司或者新设的公司承继。