人民法院对于主犯适用数罪并罚的方式：在总和刑期以下、数刑中最高刑期以上，酌情决定执行的刑期。数罪并罚是指对犯两个以上罪行的犯人，就所犯各罪分别定罪量刑后，按一定原则判决宣告执行的刑罚。

一、减刑后再犯新罪怎么处理?

刑法规定被判处管制、拘役、有期徒刑、无期徒刑的犯罪分子，在执行期间，如果认真遵守监规，接受教育改造，确有悔改表现的，或者有立功表现的，可以减刑。在减刑后刑罚执行完毕前再犯新罪的，应当按照法律规定数罪并罚的方法执行。数罪并罚分为判决宣告前的数罪并罚和判决宣告后的数罪并罚。判决宣告后的数罪并罚又分为判决宣告后发现漏罪的和又犯新罪的数罪并罚。判决宣告以后又犯新罪的并罚是指刑罚执行完毕以前，被判刑的犯罪分子又犯罪的，应当对新犯的罪作出判决，把前罪没有执行的刑罚和后罪所判处的刑罚，在总和刑期以下、数刑中最高刑期以上，酌情决定执行的刑期。但是管制最高不能超过三年，拘役最高不能超过一年，有期徒刑总和刑期不满三十五年的，最高不能超过二十年，总和刑期在三十五年以上的，最高不能超过二十五年。

二、行政处罚限制加重原则

限制加重原则，是指数罪并罚原则的一种。将犯罪分子所犯各罪分别定罪量刑，然后在总和刑以下，数罪中的最高刑以上，酌情决定应当执行的刑罚，并规定刑期不能超过一定的限度。本原则可以克服吸收原则和并科原则的缺点，便于根据罪行确定适当的原则，但其仅适用于有期徒刑、拘役、管制等刑罚，对死刑、无期徒刑则不能适用。中国刑法规定，判决宣告前一人犯数罪的，除判处死刑和无期徒刑的以外，应当在总和刑期以下，数刑中最高刑期以上，酌情决定执行的刑期;但管制最高不能超过三年，拘役最高不能超过一年，有期徒刑最高不能超过二十年。

三、减刑后再犯新罪怎么处理？

减刑后再犯新罪处理如下：在减刑后刑罚执行完毕前再犯新罪的，应当按照法律规定数罪并罚的方法执行。数罪并罚分为判决宣告前的数罪并罚和判决宣告后的数罪并罚。数罪并罚是指对犯两个以上罪行的犯人，就所犯各罪分别定罪量刑后，按一定原则判决宣告执行的刑罚。数罪，指一人犯几个罪。数罪并罚特点如下：

1、必须是一个行为人犯有数罪；

2、一个行为人犯的数罪必须发生于法定的时间界限之内；

3、必须在对数罪分别定罪量刑的基础上，依照法定的并罚原则决定最终应当执行的刑罚。