可以自行选择交通事故鉴定机构。但是自行选择的鉴定机构必须满足如下条件，否则鉴定结论不具有效力：

1、自行选择的伤残鉴定机构是卫生行政主管部门许可的医疗机构；

2、该鉴定机构中具有执业资格的医生做出的鉴定证明。

可否自主选择交通事故鉴定机构自行委托：

鉴定机构可以自行寻找一个相对熟悉而又专业点的机构，且出鉴定报告时间上会快点，但鉴定费一般要自行承担，且对方有要求重新鉴定的可能性；

法院委托：

鉴定机构只能通过摇号确定，没有选择权，且一般通过法院委托的，鉴定机构从严鉴定。

另，通过法院委托鉴定，从时间上要长很大，一般至少需要3个月或以上。

但，鉴定费由责任方承担。

《交通事故处理程序规定》第四十条第四款规定：

“具备资格的检验、鉴定、评估机构应当向省级人民政府公安机关交通管理部门备案，公安机关交通管理部门可以向当事人介绍符合条件的检验、鉴定、评估机构，由当事人自行选择。”由社会上的检验鉴定评估机构出具的结论报告，仅仅是一种参考，或者说是一种依据，并不能作为最终定案全部证据。

当警方不采信鉴定报告时，当事人还可以重新请鉴定机构重做鉴定，如果和保险公司结论差距太大，使赔偿无法进行，还可以上法庭，由法庭邀请第三方鉴定机构重新鉴定。

一般鉴定机构不接受个人委托，所以当事人可以申请由公安机关交通管理部门或律师事务所来委托鉴定，也可以起诉到法院后由双方共同申请由法院委托鉴定。

在司法实践中经常遇到单方委托鉴定后一方不认可鉴定结果的情况，因此诉到法院后申请法院委托鉴定更为妥当。

《道路交通事故处理程序规定》第三十七条

需要进行检验、鉴定的，公安机关交通管理部门应当自事故现场调查结束之日起三日内委托具备资格的鉴定机构进行检验、鉴定。尸体检验应当在死亡之日起三日内委托。

对现场调查结束之日起三日后需要检验、鉴定的，应当报经上一级公安机关交通管理部门批准。

对精神病的鉴定，应当由省级人民政府指定的医院进行。

第三十九条

卫生行政主管部门许可的医疗机构具有执业资格的医生为道路交通事故受伤人员出具的诊断证明，公安机关交通管理部门可以作为认定人身伤害程度的依据。