1、申请机构不一样。商标是通过商标局进行申请的，版权是通过中国版权登记中心进行登记的。保护对象不同。我国商标权的获得必须履行商标注册程序，而且实行申请在先原则。

2、法律依据：《中华人民共和国商标法》规定，经商标局核准注册的商标为注册商标，商标注册人享有商标专用权，受法律保护。著作权一般自动产生，不需要经过某些特别程序，根据《中华人民共和国著作权法》的规定，我国的公民和法人以及非法人组织是以作品的完成为著作权产生的标志而不是发表时。

保护期限不同。商标的期限只有十年有限期，超过十年需要进行商标续展。而版权进行登记之后，保护期为作者终生及死后五十年。

一、商标未经使用不产生侵权责任

商标未经使用产生侵权责任，因为虽然说还没有正式的来投入到使用当中，但是这个商标已经通过注册了，协商确定赔偿金或者是起诉都是注册但未使用商标侵权案件的处理方式，我国《商标法》第3条规定：“经商标局核准注册的商标为注册商标，包括商品商标、服务商标和集体商标、证明商标；商标注册人享有商标专用权，受法律保护。”即我国商标权的取得以注册为前提，只要经过注册取得专用权即受到法律的保护。

虽然有些商标在注册后没有实质的使用，甚至没有使用过，但根据我国商标法的规定，这些商标只要没有连续3年未使用且经过商标局法定程序的撤销，即是合法有效的。而且排除那些利用不正当手段的恶意抢注行为，我国商标法的先注册原则是允许抢先注册商标的，这从我国商标法的注册程序上可以看出，而对于那些使用了商标只是赋予了它注册申请时优先注册的权利。

我国《商标法》规定了商标权人享有商标专用权、禁止权、使用许可权、转让权、续展权等内容。我国商标法第38条规定“注册商标有效期满，需要继续使用的，应当在期满前六个月内申请续展注册”。第44条规定商标局对自行改变注册商标、连续三年停止使用等行为，可以责令限期改正或撤销其注册商标。《商标法实施条例》第4条规定被撤销的注册商标，由商标局予以公告，注册商标专用权自商标局的撤销决定做出之日起终止。这些法律规定了商标权人对拥有的注册商标的一些权利，这种权利是以注册商标本身为内容的，如对注册商标标识的改变，权利的续展，即使属于撤销的情形也应经过商标局的法定程序，否则仍拥有商标专用权的内容。

二、驰名商标是不是注册商标

驰名商标，又称为周知商标，最早出现在1883年签订的《保护工业产权巴黎公约》。我国于1984年加入该公约，成为其第95个成员国。和其他加入《巴黎公约》的成员国一样，依据该公约的规定对驰名商标给予特殊的法律保护，已经成为我国商标法制工作中的一个重要组成部分。驰名商标，是中国国家工商行政管理局商标局，根据企业的申请，官方认定的一种商标类型，在中国国内为公众广为知晓并享有较高声誉。对驰名商标的保护不仅仅局限于相同或者类似商品或服务，就不相同或者不相类似的商品申请注册或者使用时，都将不予注册并禁止使用，因此驰名商标被赋予了比较广泛的排他性权利。而且驰名商标持有企业的公司名以及网址域名都会受到不同于普通商标的格外法律保护。商标注册是商标使用人取得商标专用权的前提和条件，只有经核准注册的商标，才受法律保护。驰名商标和名牌是不同领域的两个不同概念。具体地讲，驰名商标通常是指市场上享有较高声誉的商标，而注册商标是个法律的概念，它的产生经过严格的法律程序，由司法机关或行政管理部门依法认定的，其目的在于解决商标权利冲突，保护驰名商标人的合法权益。所以，驰名商标不一定是注册商标。