1、转让软件著作权的使用权按销售无形资产税目缴纳增值税，税率11%；小规模纳税人征收率3%.

2、转让软件著作权的使用权收入计入其他业务收入，相应的费用计入其他业务成本，相应的税费在税金及附加科目核算，形成的所得与当期应纳税所得额一并缴纳企业所得税。

一、软件著作权企业登记有哪些优惠政策？

1、享受国家优惠政策：办理软件著作权登记的企业可享受国家各种优惠政策，包括投融资、税收、出口政策等，具体可参见国务院18号文件；

2、“双软认定”的前提：软件著作权登记是企业办理“双软认定”(软件产品登记、软件企业认定)的必要前提。信息产业部的《软件产品登记管理办法》的第七条第四款规定，软件登记时要提交知识产权证明。此知识产权证明即指《软件著作权登记证书》；

3、可作为技术出资入股：《关于以高新技术成果出资入股若干问题的规定》规定：“计算机软件可以作为高新技术出资入股，而且作价的比例可以突破公司法20%的限制达到35%。”甚至有的地方政府规定“可以100%的软件技术作为出资入股”，但都要求必须首先办理软件著作权登记；

4、申请科技成果的依据：科学技术部关于印发《科技成果登记办法》的通知第八条规定：“办理科技成果登记应当提交《科技成果登记表》及下列材料：(一)应用技术成果：相关的评价证明(鉴定证书或者鉴定报告、科技计划项目验收报告、行业准入证明、新产品证书等)和研制报告；或者知识产权证明(专利证书、植物品种权证书、软件登记证书等)和用户证明”。这里的软件登记证书指的是软件著作权登记证书和软件产品登记证书。其他部委也有类似规定；

5、企业破产后的有形收益：软件著作权作为企业的“无形资产”，不会随企业的破产而消失。企业破产后，无形资产的生命力和价值仍然存在，可以在转让和拍卖中获取有形资金；

6、予以重点保护：计算机软件著作权登记是我国著作权法规所规定的对计算机软件著作权保护的一项行政辅助管理措施，《计算机软件著作权登记办法》第二条和国务院18号文件均有规定，国家著作权行政管理部门鼓励著作权人进行计算机软件著作权登记，并对已登记的软件给予重点保护。

软件著作权登记文件是对登记事项的初步证明，对确定软件著作权的归属、理顺著作权关系、减少著作权纠纷以及打击非法盗版等有着积极的作用。