一、水利工程拖欠工程款后如何保护自己的权益

1．通过电话和函件催收。经常给发包方公司打电话，询问工程款进度。要注意打电话的时候记得录音，防止对方钻法律空子，提前保留好证据。还可以通过挂号信的方法给发包方公司发催收函并且留底，用来阻断诉讼时效。

2．亲自到对方公司上门催收的。可以经常去对方公司上门催收，老板也可能会因为不堪其扰，然后就会把工程款还上。

3．委托律师代为催收的。如果考虑到自己不懂如何催收工程款或者精力有限，可以委托专业律师处理，律师可以通过谈判、发律师函等方法进行催收。

4．向人民法院诉讼或者仲裁。向人民法院提起诉讼或者仲裁的同时，建议提供担保冻结发包方的银行账户等财产，以免对方公司转移财产，这些手段都会给发包方造成较大的影响，发包方也会经常因为这个而主动联系当事人进行谈判。

5．通过媒体向欠债公司施加压力。如果发包方在社会的知名度比较高或者忌惮舆论压力的，可以通过这种方式向媒体曝光，催收工程款。

二、拖欠工程款诉讼时效

拖欠工程款，属于民事纠纷，依据相关规定，民事案件的诉讼时效为3年。因此，当事人被拖欠工程款后，要在3年的期间内向法院提起诉讼。诉讼时效期间自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。

法律依据：

《中华人民共和国民法典》第一百八十八条

向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年，法律另有规定的，依照其规定

近讼时效期间自权利人知道或者应当知道权利变到损害以及义务人之日把计算，法律只有规定的，依照其规定，但息，自权利要到损害之日把招过二十年的，人民法院不予保护，有特殊情况的，人民法院可以根据权利人的申请决定延长。

三、拖欠工程款利息怎么计算

拖欠工程款利息的计算：法律规定，当事人对欠付工程价款利息计付标准有约定的，按照约定处理。没有约定的，按照同期同类贷款利率或者同期贷款市场报价利率计息。

《中华人民共和国民法典》：第九章　诉讼时效　　第一百八十八条　向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。法律另有规定的，依照其规定。\n　　诉讼时效期间自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。法律另有规定的，依照其规定。但是，自权利受到损害之日起超过二十年的，人民法院不予保护，有特殊情况的，人民法院可以根据权利人的申请决定延长。