员工获得的经济补偿金要扣个税。

财政部、国家税务总局《关于个人与用人单位解除取得的一次性补偿收入征免问题的通知》（财税【2001】157号）第1条规定：个人因与用人单位解除劳动关系而取得的一次性补偿收入（包括用人单位发放的、生活补助费和其他补助费用），其收入在当地上年职工平均工资3倍数额以内的部分，免征个人所得税；超过的部分按照《国家税务总局关于个人因解除劳动合同取得经济补偿金征收个人所得税问题的通知》（国税发【1999】178号）的有关规定，计算征收个人所得税。第2条规定：个人领取一次性补偿收入时按照国家和地方政府规定的比例实际缴纳的住房公积金、医疗保险费、基本费、失业保险费，可以在计征其一次性补偿收入的个人所得税时予以扣除。

一、经济补偿金的适用范围

经济补偿金是用人单位解除劳动合同时，给予劳动者的经济补偿。经济补偿金是在劳动合同解除或终止后，用人单位依法一次性支付给劳动者的经济上的补助。

劳动合同法第46条，有下列情形之一的，用人单位应当向劳动者支付经济补偿：

1、劳动者依照本法第三十八条规定解除劳动合同的；

2、用人单位依照本法第三十六条规定向劳动者提出解除劳动合同并与劳动者协商一致解除劳动合同的；

3、用人单位依照本法第四十条规定解除劳动合同的；

4、用人单位依照本法第四十一条第一款规定解除劳动合同的；

5、除用人单位维持或者提高劳动合同约定条件续订劳动合同，劳动者不同意续订的情形外，依照本法第四十四条第一项规定终止固定期限劳动合同的；

6、依照本法第四十四条第四项、第五项规定终止劳动合同的；

7、法律、行政法规规定的其他情形。

二、员工拒签合同也应有经济补偿金

不管在什么时侯，员工拒签劳动合同的，都将使单位处于赔偿风险之中。因此，员工拒签合同的，应当立即通知终止合同，办理离职手续。补偿、工资等等终止后再理论不迟。及时通知才能及时止损，避免进一步赔偿的发生。在用工一个月内拒签的，终止后按实结算报酬即可，用工一个月以上的，需支付一个月以后期间双倍工资并计算经济补偿金（劳动合同法实施条例第五条自用工之日起一个月内，经用人单位书面通知后，劳动者不与用人单位订立书面劳动合同的，用人单位应当书面通知劳动者终止劳动关系，无需向劳动者支付经济补偿，但是应当依法向劳动者支付其实际工作时间的劳动报酬。