权利人在两年时效之后提起诉讼，如果该专利权在有效期内，人民法院仍应判决被告停止侵权行为，赔偿要求可从提起诉讼之日起向前推两年计算，即超过两年部分不予支持，两年规定时效之后的仍应判决，以确保专利人的权益和对侵权者的惩罚。诉讼时效，是确保当事人的诉讼请求是否能获得人民法院的支持的时间规定，越过规定的诉讼时效，权利人的请求得不到支持，侵权人也不会因侵权而受到制裁，两年诉讼时效是否有效，计算的起算日期便成了关键，在专利法及司法解释中都明确规定从“知道”或者“应当知道”起计算。法律中规定的知道，是指权利人或者利害关系人知道侵权行为发生，自己的权利被侵害；而应当知道是指权利人或利害关系人对侵权行为在客观上存在着知道的条件和可能性，由于主观上的大意而没有知道自己的权利被侵害，过后知道了也应从客观上存在知道的条件产生之日计算诉讼时效。如两年前侵权人就侵权产品公开广告或参加展销，由于权利人主观上的过错没有知道自己权利被侵害，两年后知道了，其诉讼时效仍应从两年前起算。

一、民事诉讼时期的计算

《民法典》第一百八十八条规定，诉讼时效期间自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。这是法律对普通诉讼时效期间和特别诉讼时效期间计算的原则性规定。根据这一规定，当事人的民事权利受到侵害的，法律对其保护的期限自当事人实际知道自己的权利受到侵害之时开始计算；如果当事人虽然实际上并不知道自己的权利受到侵害，但在通常情况下一般人都可以发现自己的权利受到侵害，只是由于当事人自己的疏忽而没有发现，即当事人应当知道而不知道，在这种情况下，则从当事人应当知道自己的权利受到侵害之时开始计算。

在下列情况下，诉讼时效期间的计算方法是：

（1）附条件、附期限的请求权，从条件成就、期限到来时开始计算；

（2）有履行期限的请求权，从履行期限届满之时开始计算；

（3）无履行期限的请求权，从权利人可以行使权利之时开始计算；

（4）因违约行为而发生的强制实际履行请求权、损害赔偿请求权和违约金请求权，从违约行为成立之时开始计算；

（5）因侵权行为发生的请求权，从受害人知道有侵害行为及加害人之时开始计算；

（6）人身损害赔偿的诉讼时效期间，伤害明显的，从受伤害之日计算；伤害当时未曾发现，后经检查确诊并能证明是由伤害引起的，从伤势确诊之日计算。

最长诉讼时效期间，无论权利人是否知道其权利受到侵害，均从权利被侵害之日起开始计算。