员工申请撤销工伤认定也是会备案的。工伤认定是社会保险行政部门(当下为人社局)依据法律的授权对职工因事故伤害(或者患职业病)是否属于工伤或者视同工伤给予定性的行政确认行为，有权作出，就有权撤销。一般情况下，自己本人撤销工伤认定申请以后，是不能申请再次认定的。

一、相关法律依据

《工伤保险条例》

第五十五条有下列情形之一的，有关单位或者个人可以依法申请行政复议，也可以依法向人民法院提起行政诉讼：

(一)申请工伤认定的职工或者其近亲属、该职工所在单位对工伤认定申请不予受理的决定不服的；

(二)申请工伤认定的职工或者其近亲属、该职工所在单位对工伤认定结论不服的；

(三)用人单位对经办机构确定的单位缴费费率不服的；

(四)签订服务协议的医疗机构、辅助器具配置机构认为经办机构未履行有关协议或者规定的；

(五)工伤职工或者其近亲属对经办机构核定的工伤保险待遇有异议的。

二、撤销工伤认定决定是怎么规定的

人社局可以撤销自己作出的工伤认定决定书。工伤认定是社会保险行政部门(当下为人社局)依据法律的授权对职工因事故伤害(或者患职业病)是否属于工伤或者视同工伤给予定性的行政确认行为，有权作出，就有权撤销。

最高人民法院《关于审理工伤保险行政案件若干问题的规定》法释〔2014〕9号

第九条因工伤认定申请人或者用人单位隐瞒有关情况或者提供虚假材料，导致工伤认定错误的，社会保险行政部门可以在诉讼中依法予以更正。

工伤认定依法更正后，原告不申请撤诉，社会保险行政部门在作出原工伤认定时有过错的，人民法院应当判决确认违法；社会保险行政部门无过错的，人民法院可以驳回原告诉讼请求。

工伤认定决定书未在规定的时间内送达违反了相应的办事程序，同时也违反了相关的规章(如人社部第8号令《工伤认定办法》第二十二条的规定，当然还有你所在地省市相关的《工伤认定办法》的相关规定)，单位以此为由要求撤销是合理的，当然，如果工伤认定决定的事实清楚，应用法律法规明确，那么人力资源和社会保障局也可按程序在撤销该认定后可再次就此次事故作出相同的认定结论。这些并不影响受伤者的合法权益。