一、土地确权证发下来了，有纠纷如何办？

对于土地确权后有纠纷的解决问题，是可以由双方当事人进行协商的；对于协商不成的情形，是可以向人民政府申请处理的；对于当事人对有关人民政府的处理决定不服的，可以自接到处理决定通知之日起三十日内以作出处理决定的人民政府为被告提起行政诉讼。

法律依据：《中华人民共和国土地管理法》第十四条

土地所有权和使用权争议，由当事人协商解决；协商不成的，由人民政府处理。

单位之间的争议，由县级以上人民政府处理；个人之间、个人与单位之间的争议，由乡级人民政府或者县级以上人民政府处理。

当事人对有关人民政府的处理决定不服的，可以自接到处理决定通知之日起三十日内，向人民法院起诉。

在土地所有权和使用权争议解决前，任何一方不得改变土地利用现状。

二、土地权属争议案件由谁负责调处？

1、个人之间、个人与单位之间、单位与单位之间发生的争议案件，由争议土地所在地的县级国土资源行政主管部门调查处理。个人之间、个人与单位之间发生的争议案件，可以根据当事人的申请，由乡级人民政府受理和处理。

2、设区的市、自治州国土资源行政主管部门调查处理下列争议案件：跨县级行政区域的；同级人民政府、上级国土资源行政主管部门交办或者有关部门转送的。

3、省、自治区、直辖市国土资源行政主管部门调查处理下列争议案件：跨设区的市、自治州行政区域的；争议一方为中央国家机关或者其直属单位，且涉及土地面积较大的；争议一方为军队，且涉及土地面积较大的；在本行政区域内有较大影响的；同级人民政府、国土资源部交办或者有关部门转送的。

4、国土资源部调查处理下列争议案件：国务院交办的；在全国范围内有重大影响的。

对于土地确权后有纠纷的解决问题，是可以由双方当事人进行协商的；对于协商不成的情形，是可以向人民政府申请处理的；对于当事人对有关人民政府的处理决定不服的，可以自接到处理决定通知之日起三十日内以作出处理决定的人民政府为被告提起行政诉讼。

三、农村土地确权后使用年限是多少年

农村土地确权后使用年限是如下：

1、农村耕地的使用权年限为三十年，届满后再延长三十年；

2、草地和林地的使用权年限分别为三十年至五十年和三十年至七十年，届满后依法相应延长。

《农村土地承包法》第二十一条

耕地的承包期为三十年。草地的承包期为三十年至五十年。林地的承包期为三十年至七十年。

前款规定的耕地承包期届满后再延长三十年，草地、林地承包期届满后依照前款规定相应延长。

第二十四条第一款

国家对耕地、林地和草地等实行统一登记，登记机构应当向承包方颁发土地承包经营权证或者林权证等证书，并登记造册，确认土地承包经营权。

《中华人民共和国土地管理法》（2019修正）：第二章　房地产开发用地 第一节　土地使用权出让　　第十四条　土地使用权出让最高年限由国务院规定。