一般情况下，工程质量保证金的返还期限依据双方签订的建设工程施工合同的约定履行。但如果双方签订的建设工程施工合同未约定保证金期限或合同无效，则工程质量保证金应该在建设工程通过竣工验收之日起满二年的时候返还。若因发包人的原因导致建设工程未按约定期限进行竣工验收的，工程质量保证期限自承包人提交工程竣工验收报告九十日开始计算。

工程质量保证金的法律矛盾

关于工程质量保修期。关于建筑工程保修期长短的界定提法不一，相关法律规定互相矛盾。《建筑法》第62条规定：建筑工程的保修范围应当包括地基基础工程、主体结构工程、屋面防水工程和其他土建工程，以及电气管线、上下水管线的安装工程，供热、供冷系统工程等项目；保修的期限应当按照保证建筑物合理寿命年限内正常使用，维护使用者合法权益的原则确定。具体的保修范围和最低保修期限由国务院规定。据此规定，国家《建设工程质量管理条例》和《房屋建筑工程质量保修办法》规定：基础设施工程、房屋建筑的地基基础工程和主体结构工程，为设计文件规定的该工程的合理使用年限；屋面防水工程、有防水要求的卫生间、房间和外墙面的防渗漏，为5年；供热与供冷系统，为2个采暖、供冷期；电气管线、给排水管道、设备安装和装修工程为2年。而财政部《基本建设财务管理规定》和《工程价款结算暂行办法》对工程质保金预留期限界定为待工程竣工一年后再清算。《建设工程质量保证金管理暂行办法》规定：缺陷责任期一般为6个月、12个月或24个月。

纵观以上规定，在建筑工程保修范围上，有两种不同类型的划分：一是基础、主体类，二是建筑通病类。体现在保修期限上，就是终身保修和短期保修。在短期保修上出现5年、2年、1年和半年的不同。伸缩性差异颇大，幅度相去甚远，哪个规定为准，难以确定。

关于工程质量保证金。对于保证金的留存额度法律上同样存在不同提法：《基本建设财务管理规定》《建筑工程质量保证金管理暂行办法》和《工程价款结算暂行办法》等文件要求预留质保金的额度为工程价款结算总额的5％；而建设主管部门和工商管理部门联合审定的《建设工程施工合同》文本中则规定：工程质量保证金一般不超过施工合同价款的3％。

关于保证金的返还期限。对保证金返还期限的规定也模糊不清：《建设工程质量管理条例》等规定对包括基础工程、主体工程、防水工程、采暖制冷工程和电气管线、设备安装和装修工程等的保修期分别予以年限划定，有的规定5年，有的｀规定2年。

《最高人民法院关于审理建设工程施工合同纠纷案件适用法律问题的解释（二）》第八条：

有下列情形之一，承包人请求发包人返还工程质量保证金的，人民法院应予支持：

（一）当事人约定的工程质量保证金返还期限届满。

（二）当事人未约定工程质量保证金返还期限的，自建设工程通过竣工验收之日起满二年。

（三）因发包人原因建设工程未按约定期限进行竣工验收的，自承包人提交工程竣工验收报告九十日后起当事人约定的工程质量保证金返还期限届满；当事人未约定工程质量保证金返还期限的，自承包人提交工程竣工验收报告九十日后起满二年。

发包人返还工程质量保证金后，不影响承包人根据合同约定或者法律规定履行工程保修义务。