行政机关及其工作人员实施行政许可，有可能侵犯公民、法人或者其他组织的合法权益。根据本条的规定，行政机关对其在实施行政许可过程中的违法行为，给当事人的合法权益造成损害的，应当承担赔偿责任。行政机关违法实施行政许可，当事人的合法权益造成损失，有两种情况：

1、行政机关违法实施行政许可，自行政许可依法生效至当事人从事行政许可事项的生产经营等活动结束，行政许可都没有被撤销。在此情况下行政许可给当事人的合法权益造成损害的，行政机关应当承担赔偿责任，因为当事人合法权益的损害是由行政机关违法实施行政许可的行为引起和造成的。比如，申请人不具备从事爆炸物等危险物品的生产条件和能力，行政机关却违法实施行政许可，导致申请人在生产过程中因不符合许可条件而发生严重事故。再比如，申请人不符合排污许可所应当具备的法定条件，行政机关却违法向其发放排污许可证，导致申请人周围的利害关系人受到严重污染损害。在这些情况下，行政机关都应当对其违法实施行政许可的行为承担赔偿责任。

2、行政机关因违法实施行政许可，而导致该行政许可被依法撤销。行政许可由于被撤销而给被许可人和利害关系人的合法权益造成损害的，行政机关应当承担赔偿责任。在行政许可领域，行政处罚的种类主要包括：警告、罚款、撤销许可以及法律、法规规定的其他行政处罚措施；对因行政许可主体及公务人员的行为违法，造成了相对人一定损失的，予以一定的补偿。此类法律责任承担形式还有承认错误、赔礼道歉；恢复名誉、消除影响；履行职务；撤销违法；纠正不当；返还权益，恢复原状；行政赔偿等等。

行政许可的办理

《行政许可法》规定：对行政许可需要行政机关内设的多个机构办理的，该行政机关应当确定由一个机构统一受理行政许可申请，统一送达行政许可决定。比如：某项行政许可涉及到林业局的几个处室，则林业局应当确定由其中一个处室来受理公民、法人或其他组织提出的行政许可申请，并负责送达行政许可的决定。行政许可依法由地方人民政府两个以上部门分别实施的，本级人民政府可以由确定一个部门受理行政许可申请，该部门受理后要转告有关部门分别提出意见后统一办理，或者组织有关部门联合办理、集中办理。比如某项行政许可涉及县级人民政府的建设、环保和国土资源三个部门，则县级人民政府可以交由建设部门受理行政许可申请，建设部门受理后要转告环保、国土资源部门分别提出办理意见，或者组织环保、国土资源部门联合办理行政许可，或是集中办理行政许可。

《中华人民共和国公司法》第一百九十九条公司的发起人、股东虚假出资，未交付或者未按期交付作为出资的货币或者非货币财产的，由公司登记机关责令改正，处以虚假出资金额百分之五以上百分之十五以下的罚款。