结婚登记瑕疵并不是一个法律概念，从目前使用的特定语境看，主要是指在结婚登记中存在程序违法或欠缺必要形式要件等缺陷。比如，一方或双方当事人未亲自到场办理结婚登记、借用或冒用他人身份证明进行结婚登记、婚姻登记机关越权管辖、当事人提交的婚姻登记材料有瑕疵等。因而，他不属于《民法典》第一千零五十一条规定的无效婚姻以及第一千零五十三条规定的可撤销婚姻情形，故不能申请法院直接撤销该婚姻关系。

另外，《婚姻登记条例》对当事人弄虚作假、骗取婚姻登记的情形并未规定婚姻登记机关可撤销其婚姻登记，故，适用后法优于前法的法律适用原则。

婚姻登记机关没有得到授权行使宣告婚姻无效的权利，仅被授权对胁迫结婚的，依当事人的申请行使撤销婚姻的职责。而依法理，行政机关要行使某项权能和职责，必须要经过法律、法规的明确授权。

结婚登记中的瑕疵，应当区别是重大瑕疵还是一般瑕疵，对于存在一般瑕疵能够通过补正等方式解决的，不轻易否定结婚登记的效力。

对要求结婚登记的双方当事人进行审查尤其是身份真实性、合法性的审查是婚姻登记机关的程序义务。行政诉讼法第五十四条规定，作出具体行政行为的主要证据不足的，人民法院可以判决撤销。按照举轻以明重的当然解释规则，主要证据不足的具体行政行为尚且可以撤销，而据以作出具体行政行为的主要证据竟是虚假的话则更有适用撤销规定的理由。该“婚姻”不是可撤销的婚姻，但该登记却是可撤销的婚姻登记，撤销了登记自然达到了消灭这种“婚姻关系”的效果。

最高人民法院行政审判庭2005年曾作出《关于婚姻登记行政案件原告资格及判决方式有关问题的答复》，指出婚姻关系双方或一方当事人未亲自到婚姻登记机关进行婚姻登记，且不能证明婚姻登记系男女双方的真实意思表示，当事人可以对该婚姻登记提起诉讼要求依法予以撤销。当事人未亲自到婚姻登记机关进行婚姻登记与当事人虽然亲自到婚姻登记机关但提供虚假身份证明进行婚姻登记的性质是一样的，因为要求当事人亲自到婚姻登记机关进行婚姻登记的一个重要目的就是要审查当事人的身份是否真实，要求结婚是否是当事人本人的真实意愿；而利用虚假身份信息登记结婚，本身就带有欺骗的性质，所以根据法律规定并按目的解释规则判决撤销婚姻登记机关的结婚登记是符合法律规定的。