工伤认定申请不通过的情形有：

(1)对于工伤认定未能提交充分资料，同时在行政机关发出补正通知书后，规定时间内未能做出补正的，工伤认定机关理应不受理。

(2)对于工伤认定超过申请时效的，除特殊原因外，工伤认定机关可以驳回申请，不予受理。

(3)伤者或者伤者家属、用人单位，对所申请的，不予受理的工伤认定决定不服的，可以于60日内；

向当地人民政府，或者高一级人力资源和社会保障行政部门，提起行政复议，或者在90日内，直接向当地人民法院提起诉讼。

一、工伤认定中止应该怎么恢复

我国相关法律法规，针对工伤认定程序，没有中止中止这一规定。但由于职工因工遭受伤害需要申请工伤认定时，往往由于缺乏对我国工伤认定程序的系统认识，从而在申请工伤认定时，由于准备不足，导致相关材料缺失或者证据不充分，需要进一步补充相关材料。依据工伤认定办法规定可知，工伤职工或者其近亲属自将工伤认定所需材料递交给社保行政部门15日内，社保行政部门需要对所提交材料进行审核，材料不完整的，会以书面形式告知工伤职工，或者其近亲属需要补充的材料。在材料补充期间，工伤认定程序暂时中止。当然，在工伤职工或其近亲属补正所有材料，并将全部补正材料递交给工伤认定部门，工伤认定部门会自动恢复工伤认定程序，一般会在15天内做出受理或者不予受理的决定。

二、法律规定工伤认定应该怎么认定

工伤认定的流程：

1、申请。用人单位应当自事故伤害发生之日或者被诊断、鉴定为职业病之日起30日内提出工伤认定申请；单位未提出的，工伤职工或者其直系亲属、工会组织在事故伤害发生之日或者被诊断、鉴定为职业病之日起1年内提出工伤认定申请。

2、审核。社会保险行政部门应当对工伤认定的申请进行审核，经审核对于提交的材料不全的，应当一次性书面告知工伤认定申请人需要补正的全部材料。补全材料或者材料本身就齐全的，社会保险行政部门受理申请。

3、核实。社会保险行政部门受伤工伤认定申请后对事故伤害进行调查核实，用人单位、职工、工会组织、医疗机构以及有关部门应当予以协助。

4、作出决定。社会保险行政部门应当自受理工伤认定申请之日起60日内作出工伤认定的决定，并书面通知申请工伤认定的职工或者其近亲属和该职工所在单位。