承包人行使法定抵押权有两种方式：

一为与发包人协议折价。

二为向法院申请拍卖。

一、抵押权如何行使

可以与抵押人协议以抵押财产折价或者以拍卖、变卖该抵押财产所得的价款优先受偿。《民法典》第四百一十条【抵押权的实现】债务人不履行到期债务或者发生当事人约定的实现抵押权的情形，抵押权人可以与抵押人协议以抵押财产折价或者以拍卖、变卖该抵押财产所得的价款优先受偿。协议损害其他债权人利益的，其他债权人可以请求人民法院撤销该协议。抵押权人与抵押人未就抵押权实现方式达成协议的，抵押权人可以请求人民法院拍卖、变卖抵押财产。抵押财产折价或者变卖的，应当参照市场价格。

二、在建工程转让承包人如何行使优先权

(1)催告程序这是承包人行使建设工程优先权的首要程序，也是必要程序。发包人未按合同约定支付价款时，承包人有权催告发包人在合理期限内支付价款。一般认为，合理期限的时间应在2个月以上。承包人没有经过催告程序的，不的直接向法院提起拍卖申请。

(2)协议折价和申请拍卖程序承包人通过催告程序，发包人仍然不支付价款的，除按照建设工程的性质不宜折价外，承包人可以与发包人协议将工程折价，用折价所得偿付工程价款;也可以申请法院将该工程拍卖，用拍卖所得偿付工程价款。拍卖应按拍卖法及相关规定进行。

(3)依照建设工程的性质不宜折价、拍卖的，不能折价或拍卖。所谓不宜折价或拍卖，是指该工程具有特殊用途不适合将其出售给第三人。如高速公路、桥梁涵洞、政府办公楼、学校教学楼等。不过，这些建设工程虽然不宜折价或拍卖，但如果这些工程可以用来经营，并能取得经济效益的，承包人可以要求以其经营所得优先偿还建设工程的款项。如高速公路所收取的高速公路通行费等。

三、甲方拖欠工程款怎么办

可以先行与甲方协商要求支付工程款，当甲方逾期未支付且协商不成时，承包人可以行使工程价款优先受偿权，诉至法院请求将该工程查封，以折价或拍卖的方式清偿工程款。该权利是法律赋予承包人的特殊权利，为了保护承包人的合法利益。其效力优先于一般的债权和抵押权，行使便利有效，且法律风险低。