我国法律上虽然明确规定了行政诉讼的诉讼时效，一般在知道该行政行为作出后的六个月内处理，但对于超过这一期限的，如果双方可以协商达成一致意见，并且继续履行义务的，那么也是可以的，具体情况可以结合实际而定。超过行政诉讼起诉期限，则当事人丧失了向人民法院提起行政诉讼的权利。诉讼时效届满，导致权利人的胜诉权消失，人民法院不再予以强制保护。但是，权利人基于民事法律关系所享有的民事权利（实体权利）仍然存在，所以，义务人在诉讼时效届满之后自愿向权利人履行义务的，权利人仍然有权接受。

超过行政诉讼的执行期限该怎么办呢

1、当事人向人民法院申请执行，必须在法定期限内提出。法定期限内当事人未提出申请的，即丧失了请求人民法院强制执行生效法律文书以实现实体权利的权利。

《中华人民共和国民事诉讼法》第二百三十九条对申请执行的期限作了一般性的规定，即“申请执行的期间为二年。申请执行时效的中止、中断，适用法律有关诉讼时效中止、中断的规定。”

2、申请法院强制执行的期限也存在以下特殊情形：根据《最高人民法院关于执行中华人民共和国行政诉讼法若干问题的解释》（以下简称《解释》）第八十三条、第八十四条，对发生法律效力的行政判决书、行政裁定书、行政赔偿判决书和行政赔偿调解书，负有义务的一方当事人拒绝履行的，对方当事人可以依法申请人民法院强制执行。申请人是公民的，申请执行的期限为1年，申请人是行政机关、法人或者其他组织的为180日。

根据《解释》第八十八条，行政机关申请人民法院强制执行其具体行政行为，应当自被执行人的法定起诉期限届满之日起180日内提出。逾期申请的，除有正当理由外，人民法院不予受理。

根据《解释》第九十条，行政机关根据法律的授权对平等主体之间民事争议作出裁决后，当事人在法定期限内不起诉又不履行，作出裁决的行政机关在申请执行的期限内未申请人民法院强制执行的，生效具体行政行为确定的权利人或者其继承人、权利承受人在90日内可以申请人民法院强制执行。

《中华人民共和国行政诉讼法》第四十六条公民、法人或者其他组织直接向人民法院提起诉讼的，应当自知道或者应当知道作出行政行为之日起六个月内提出。法律另有规定的除外。

因不动产提起诉讼的案件自行政行为作出之日起超过二十年，其他案件自行政行为作出之日起超过五年提起诉讼的，人民法院不予受理。

《关于适用中华人民共和国民事诉讼法若干问题的意见》第一百五十三条当事人超过诉讼时效期间起诉的，人民法院应予受理。受理后查明无中止、中断、延长事由的，判决驳回其诉讼请求。