在多次借款的情况下,如果其中一部分借款已经超过了约定的还款期限且已经超过三年,那么这部分借款已经超出了诉讼时效。由于多次借款是不相关连的独立的借款行为,每一笔借款均有其金额、期限、利息等问题的约定。因此,债权人应当知道其权利被侵犯的情况,其他借款是否到期及是否再发生借款行均不构成该笔借款诉讼时效的中止或中断的情形。所以,每笔借款应分别计算诉讼时效。

在多次借款的情况下,在起诉时有一部分借款已经超过了约定的还款期限,届满已经超过了三年。在这种情况下,这部分借款已经超出了诉讼时效。因多次借款是不相关连的独立的借款行为，每一笔借款均有其金额、期限、利息等问题的约定。在每一笔借款期限届满之日起债权人都应当知道其权利被侵犯，其他借款是否到期及是否再发生借款行均不构成该笔借款诉讼时效的中止或中断的情形，故每笔借款应分别计算诉讼时效。

连续借款的诉讼时效计算方法是什么？

根据我国《民法典》的规定，连续借款的诉讼时效计算方法为从贷款到期日开始计算，期间为二年。在贷款期限内，借款人可以展期，但展期后的贷款期限不得超过原贷款期限的一半。

需要注意的是，在贷款期限内，借款人提前归还贷款的，可以按照实际借款期限计算诉讼时效。另外，如果贷款人与借款人未约定利率或者约定不明，则应按照同期银行贷款利率计算诉讼时效。

在实际操作中，如果借款人逾期未还贷款，贷款人可以采取多种催收措施，包括向借款人发出催收通知、提供贷款对账单、联系第三方机构催收等。如果借款人逾期未还的贷款金额较大，贷款人可以通过法律手段来追回欠款，包括向法院提起诉讼、申请仲裁等。

综上所述，连续借款的诉讼时效计算方法为从贷款到期日开始计算，期间为二年。在贷款期限内，借款人可以展期，但展期后的贷款期限不得超过原贷款期限的一半。如果贷款人与借款人未约定利率或者约定不明，则应按照同期银行贷款利率计算诉讼时效。

结论：在多次借款的情况下，如果有一部分借款已经超过了约定的还款期限且已经超过三年，那么这部分借款已经超出了诉讼时效。因此，在起诉时，应当分别计算每笔借款的诉讼时效。根据《民法典》的规定，连续借款的诉讼时效计算方法为从贷款到期日开始计算，期间为二年。在贷款期限内，借款人可以展期，但展期后的贷款期限不得超过原贷款期限的一半。如果贷款人与借款人未约定利率或者约定不明，则应按照同期银行贷款利率计算诉讼时效。另外，如果借款人逾期未还贷款，贷款人可以采取多种催收措施，包括向借款人发出催收通知、提供贷款对账单、联系第三方机构催收等。如果借款人逾期未还的贷款金额较大，贷款人可以通过法律手段来追回欠款，包括向法院提起诉讼、申请仲裁等。

《中华人民共和国民法典》第一百八十八条普通诉讼时效、最长权利保护期间，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。法律另有规定的，依照其规定。诉讼时效期间自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。法律另有规定的，依照其规定。但是，自权利受到损害之日起超过二十年的，人民法院不予保护，有特殊情况的，人民法院可以根据权利人的申请决定延长。