1、适用项目不同

专业分包单位：主要适用于做可行性研究阶段的辅助研究项目;勘察设计阶段的工程地质勘察、供水水源勘察、基础或结构工程设计、工艺设计，供电系统、空调系统及防灾系统的设计;

施工阶段的深基础施工、金属结构制作和安装、通风设备和电梯安装;建设准备阶段的设备选购和生产技术人员培训等专门项目。

独立专项承包单位：主要适用于做技术要求比较简单、规模不大的工程项目。

2、签订合同的方式不同

专业分包单位：建筑工程总承包单位根据总承包合同的约定或者经建设单位的允许，将承包工程中的部分工程发包给具有相应资质的分包单位。

独立专项承包单位：各个不同的承包施工公司单独与甲方签订承包合同。

一、独立分包受总包管理吗

这要看总包方与建设方签订的总包合同有关此内容的约定，无外乎两种情况。

1、总包合同中要求总包方负责整个工程的管理、组织、协调，包括为分包人提供使用水电、脚手架、起重机械、临时设施、场地及竣工资料的整理汇总，并且总包方收取一定的总包服务费。那么在分包工程质量、安全、文明施工等方面总包方与分包方承担连带责任。

2、总包合同中未约定由总包方管理分包方，总包也未收取任何费用，那么对分包工程的质量总包方不承担连带责任。

工程分包一般由总包或者业主负责，总包负责一般分包，业主负责指定分包。分包管理归总包负责，并对其进行全方位监督管理。分包与总包有直接的合同约束，具有相应的责任连带关系，而业主则不牵扯其中，很多业主运用手持式视频通信对各个分包进行协调管理，改变传统管理模式，使远程管理更为直观高效。分包对一些指定的施工任务更为专业，总包主要的任务是针对项目对各方进行协调管理。

《中华人民共和国建筑法》

第二十九条

建筑工程总承包单位可以将承包工程中的部分工程发包给具有相应资质条件的分包单位;但是，除总承包合同中约定的分包外，必须经建设单位认可。施工总承包的，建筑工程主体结构的施工必须由总承包单位自行完成。建筑工程总承包单位按照总承包合同的约定对建设单位负责;分包单位按照分包合同的约定对总承包单位负责。总承包单位和分包单位就分包工程对建设单位承担连带责任。禁止总承包单位将工程分包给不具备相应资质条件的单位。禁止分包单位将其承包的工程再分包。