当公司违法解除怀孕期间的员工劳动合同，员工有两种维权方案：

1、员工可以要求继续履行合同，并且支付工资损失到合同再继续履行时。若在案件处理过程中劳动合同到期，则仲裁或法院会撤消用人单位的解除劳动合同决定，认定双方劳动合同终止，并会要求用人单位支付到劳动合同终止之日的工资和经济补偿金。

2、如用人单位违法解除怀孕女工的劳动合同，劳动者要求继续履行劳动合同的，用人单位应该撤销解除劳动合同的决定;若员工不要求继续履行合同，要求用人单位支付违法解除的赔偿金，用人单位则应按每工作一年支付两个月工资的标准支付。

一、没按公司制度辞退员工怎么处理

没按公司制度辞退员工需要对员工支付经济补偿金，具体补偿金的标准是按照劳动者工作年限来确定的，劳动者可以收集相应的证据，申请劳动仲裁，但需确认是选择继续工作还是要求用人单位支付违法辞退的赔偿金。

用人单位违反本法规定解除或者终止劳动合同，劳动者要求继续履行劳动合同的，用人单位应当继续履行；劳动者不要求继续履行劳动合同或者劳动合同已经不能继续履行的，用人单位应当依照规定支付赔偿金。用人单位违法解除或终止劳动合同，劳动者不要求继续履行劳动合同或劳动合同已经不能继续履行的，用人单位应按规定向劳动者支付赔偿金，但无需另外支付经济补偿金。赔偿金的计算年限用工之日起连续计算。

一般劳动者都会选择主张违法辞退的赔偿金。因为届时双方的关系可能已经十分紧张，不利于双方保持良好的劳动关系。

二、辞退员工的补偿标准

辞退员工的补偿标准如下：

1、如果不是因为劳动者在试用期不符合录用条件等原因而解除劳务关的，用人单位应当向劳动者支付经济补偿，经济补偿按劳动者在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。六个月以上不满一年的，按一年计算；

2、如是用人单位违法解除劳动合同的，要按照经济补偿标准的两倍向劳动者支付赔偿金。

一、用人单位可以随时解除劳动合同的情形如下：

1、在试用期间被证明不符合录用条件的；

2、严重违反劳动纪律或者用人单位规章制度的；

3、严重失职，营私舞弊，对用人单位利益造成重大损害的；

4、被依法追究刑事责任的；

5、被劳动教养的。

二、辞职和离职的区别如下：

１、运用主体不同。解除劳动合同的运用主体可以是用人单位，也可以是劳动者。而辞职、自动离职的运用主体只是劳动者；

２、适用原因的性质不同。解除劳动合同适用的原因是双重性质的，既有惩罚性的，又有非惩罚性的。而辞职不具有惩罚性，自动离职往往是一种违法行为。