申请注册期内商标的保护方法，一般如下：

1、侵犯注册商标专用权的行为之一，引起纠纷的，由当事人协商解决；

2、不愿协商或者协商不成的，商标注册人或者利害关系人可以向人民法院起诉或者请求工商行政管理部门处理。

侵犯注册商标专用权的行为之一，引起纠纷的，由当事人协商解决；不愿协商或者协商不成的，商标注册人或者利害关系人可以向人民法院起诉或者请求工商行政管理部门处理。工商行政管理部门认定侵权行为成立的，责令立即停止侵权行为，没收、销毁侵权商品和主要用于制造侵权商品、伪造注册商标标识的工具。

商标申请注册流程

1、只有具有以下条件的个人或团体才可在中国提出商标申请

商标注册申请人必须是：依法成立的企业、事业单位、社会团体、个体工商业者、个人合伙或者与中国签订协议或与中国共同参加国际条约或按对等原则办理的国家的外国人或者外国企业。

符合上述条件，需要取得商标专用权时，按照自愿的原则，向商标局提出商标注册申请（2001年11月1日起，中国商标局开始受理自然人注册商标申请，但自2007年2月28日起，商标局已经不受理纯粹的中国境内自然人注册商标申请，中国境内的自然人申请商标的，必须执有个体工商户营业执照）。

2、按商品与服务分类提出申请

中国商标法执行的是商品国际分类，它把一万余种的商品和服务项目分为45个类，申请商标注册时，应按商品与服务分类表的分类确定使用商标的商品或服务类别。同一申请人在不同类别的商品上使用同一商标的，应当按商品分类在不同类别提出注册申请这样可以避免商标权适用范围的不正当扩大，也有利于审查人员的核准和商标专用权的保护。

3、商标申请日的确定

确立申请日十分重要，由于中国商标注册采用申请在先原则，一旦发生申请日的先后成为确定商标权的法律依据，商标注册的申请日以商标局收到申请书件的日期为准（日期的最小单位为日）。

4、商标申请注册的方式

通过商标代理机构提交商标注册的，商标代理机构可以通过纸件方式向商标局提交申请，商标代理机构向商标申请网上报送申请的，可以向商标局领取数字证书进行网络申报。以纸件方式申报的，商标申请日为商标局收到申请文件之日，以网络方式申报的，以网络申报日为申请日。

《中华人民共和国商标法》第五十七条有下列行为之一的，均属侵犯注册商标专用权：

（一）未经商标注册人的许可，在同一种商品上使用与其注册商标相同的商标的；

（二）未经商标注册人的许可，在同一种商品上使用与其注册商标近似的商标，或者在类似商品上使用与其注册商标相同或者近似的商标，容易导致混淆的；

（三）销售侵犯注册商标专用权的商品的；

（四）伪造、擅自制造他人注册商标标识或者销售伪造、擅自制造的注册商标标识的；

（五）未经商标注册人同意，更换其注册商标并将该更换商标的商品又投入市场的；

（六）故意为侵犯他人商标专用权行为提供便利条件，帮助他人实施侵犯商标专用权行为的；

（七）给他人的注册商标专用权造成其他损害的。

《中华人民共和国商标法》第六十条有本法第五十七条所列侵犯注册商标专用权行为之一，引起纠纷的，由当事人协商解决；不愿协商或者协商不成的，商标注册人或者利害关系人可以向人民法院起诉，也可以请求工商行政管理部门处理。

工商行政管理部门处理时，认定侵权行为成立的，责令立即停止侵权行为，没收、销毁侵权商品和主要用于制造侵权商品、伪造注册商标标识的工具，违法经营额五万元以上的，可以处违法经营额五倍以下的罚款，没有违法经营额或者违法经营额不足五万元的，可以处二十五万元以下的罚款。对五年内实施两次以上商标侵权行为或者有其他严重情节的，应当从重处罚。销售不知道是侵犯注册商标专用权的商品，能证明该商品是自己合法取得并说明提供者的，由工商行政管理部门责令停止销售。

对侵犯商标专用权的赔偿数额的争议，当事人可以请求进行处理的工商行政管理部门调解，也可以依照《中华人民共和国民事诉讼法》向人民法院起诉。经工商行政管理部门调解，当事人未达成协议或者调解书生效后不履行的，当事人可以依照《中华人民共和国民事诉讼法》向人民法院起诉。