法律规定医院的发票保留时间应当是五年。

开具发票的单位和个人应当按照税务机关的规定存放和保管发票，不得擅自损毁。已开具的发票存根联和发票登记簿，应当保存五年。保存期满，报经税务机关查验后销毁。

因此，已开具的发票存根和已使用的“发票登记簿”不得擅自损毁，开具后的存根联应当按照顺序号装订成册。保管期限为五年，保存期满，报经税务机关查验后销毁。

一、企业税种包括哪些

企业税种有以下：

1、流转税，包括增值税、消费税、营业税、关税、车辆购置税等；

2、所得税，包括企业所得税、外商投资企业和外国企业所得税、个人所得税等；

3、资源税，包括资源税、城镇土地使用税、土地增值税等；

4、财产税，包括房产税、城市房地产税等；

5、行为税，包括印花税、车船税、城市维护建设税等；

6、其他税，包括农林特产税、耕地占用税、契税等。

一、企业纳税申报流程如下：

1、纳税登记，企业在领取营业执照后30天之内，带上相关证件和材料去税局办理税务登记，税局收到企业的相关材料后自申报日起30天之内审核并发给单位企业税务登记证；

2、税务认定，确认纳税人是一般纳税人还是小规模纳税人，确认企业征收税款的方式，是查账征收、核定征收还是代扣代缴等；

3、发票和税盘，已经核税的企业可以向税务机关购买税控盘零购发票，依据公司业务开具发票；

4、报税，一般分为上门申报和网上申报；

5、完税证明，在企业成功纳税以后，在税务大厅可以收到完税凭证，网上报税可以去税务机关要求提取完税证明。

二、企业纳税需要的资料如下：

1、已开具的税控机动车销售统一发票和普通发票的存根；

2、符合抵扣条件并申请当期抵扣的增值税专用发票的抵扣联；

3、符合抵扣条件且在本期申报抵扣的海关进口环节增值税专用缴款书和购买符合抵扣条件的农产品当期申请抵扣的普通发票复印件；

4、符合抵扣条件且在本期申报抵扣的税收完税凭证及其清单，书面合同、付款证明和境外单位的对账单或者发票；

5、已开具的农产品收购凭证的存根联或报查联；

6、纳税人销售服务、不动产和无形资产时，在确定服务、不动产和无形资产的销售时，应当从按照有关规定从取得的全部价款和价外费用中扣除价款的合法凭证及其清单；

7、主管税务机关规定的其他材料。

总之，企业税种有流转税、所得税、资源税、财产税、行为税等。企业纳税申报需要在领取营业执照后30天之内，带上相关证件和材料去税局办理税务登记；确认纳税人是一般纳税人还是小规模纳税人，确认企业征收税款的方式；对已经核税的企业可以向税务机关购买税控盘零购发票，依据公司业务开具发票；报税；领取完税证明。

二、发票违法行为

违反发票管理法规的行为包括：

(一)未按照规定印制发票或者生产发票防伪专用品的(二)未按照规定领购发票的(三)未按照规定开具发票的(四)未按照规定取得发票的(五)未按照规定保管发票的(六)未按照规定接受税务机关检查的。

对有上述所列行为之一的单位和个人，由税务机关责令限期改正，没收非法所得，可以并处1万元以下的罚款。有前款所列两种或者两种以上行为的，可以分别处罚。