1、非独立核算分公司不属于独立核算的纳税人，财务并入总公司统一核算管理，要建立有关辅助帐、明细帐，具体根据总公司要求确定。

2、国税这块，经总公司主管税务机关同意后，分公司实行增值税预征，然后由总公司统一抵扣；营业税按公司所属地分别缴纳。

3、如果分公司与总公司经营的业务相同，分公司实行报帐制度，同时要在所属地办理相关证照。

一、分公司注意事项

1、税务登记等。要在领取营业执照后30日内办理税务登记。

是否国地税都要办，视乎你的企业所得税是国税征收还是地税征收：如果是国税收，则国地税都要办；如果地税征收，则还要看经营项目，如果是营业税为主税种，则只办地税，如果增值税为主税种，则国地税都要办。

2、申报纳税。视乎税种。

营业税在劳务发生地缴税；企业所得税由总机构汇总申报；代扣缴个人所得税由支付工薪的机构代扣缴。

3、现在税务上也不大管你是否独立核算，该汇总缴纳的（企业所得税）都要汇总缴纳，该就地缴纳的（营业税）都要就地缴纳。可以就地缴纳也可以汇总缴纳的（个人所得税），没经过审批，也就地缴纳。

4、建账问题：分公司和总公司可以采取两种方式核算：

（1）一是独立核算，也就是单独建账，对分公司的业务经营活动过程及其成果进行全面、系统的会计核算。

特点是：在管理上有独立的组织形式，具有一定数量的资金，在当地银行开户；独立进行经营活动，能同其他单位订立经济合同；独立计算盈亏，单独设置会计机构并配备会计人员，并有完整的会计工作组织体系；

（2）二是非独立核算，非独立核算又称报账制，是把本单位的业务经营活动有关的日常业务资料，逐日或定期报送上级单位，由上级单位进行核算。特点是一般由上级拔给一定数额的周转金，从事业务活动，一切收入全面上缴，所有支出向上级报销，本身不单独计算盈亏，只记录和计算几个主要指标，进行简易核算。

5、申报问题：总公司和分公司在同一地且同一管辖区的情况下，可以由总公司统一报税，如果不在同一地区，那么按照属地原则，分公司要单独在其所在地进行申报的。

二、分公司属于什么企业所得税

对于分公司等分支机构，只要符合独立核算的条件，应单独申报缴纳企业所得税，适用经营所在地的企业所得税税率。计税时，分公司和总公司应分别适用所在经营地的适用税率。

分公司作为独立纳税人，经营期间形成的年度亏损在确定总公司的年度应税所得时不能抵减，其注销前形成的累计经营亏损在总公司账面反映为无法收回的其他应收款或应收账款。