一、农村房屋被侵占怎么办

宅基地被他人侵占，可以先协商解决。如果无法协商，可以请求人民政府处理。当事人对有关人民政府的处理决定不服的，可以自接到处理决定通知之日起三十日内，向人民法院起诉。

法律依据：

《土地管理法》第十四条

土地所有权和使用权争议，由当事人协商解决。协商不成的，由人民政府处理。

单位之间的争议，由县级以上人民政府处理。个人之间、个人与单位之间的争议，由乡级人民政府或者县级以上人民政府处理。

当事人对有关人民政府的处理决定不服的，可以自接到处理决定通知之日起三十日内，向人民法院起诉。

在土地所有权和使用权争议解决前，任何一方不得改变土地利用现状。

二、房屋被侵占如何打官司

房屋被侵占打官司需要当事人提交身份证件、产权证件、起诉状等材料向房产所在地人民法院申请立案，法院通知双方受理案件，法院送达开庭公告并在七个工作日内通知双方开庭时间，开庭当日到庭辩论质证。

《民事诉讼法》

第三十三条，下列案件，由本条规定的人民法院专属管辖：

（一）因不动产纠纷提起的诉讼，由不动产所在地人民法院管辖；

（二）因港口作业中发生纠纷提起的诉讼，由港口所在地人民法院管辖；

（三）因继承遗产纠纷提起的诉讼，由被继承人死亡时住所地或者主要遗产所在地人民法院管辖。

第一百二十条，起诉应当向人民法院递交起诉状，并按照被告人数提出副本。书写起诉状确有困难的，可以口头起诉，由人民法院记入笔录，并告知对方当事人。

第一百二十六条，人民法院对决定受理的案件，应当在受理案件通知书和应诉通知书中向当事人告知有关的诉讼权利义务，或者口头告知。

三、房屋侵占的适用诉讼时效是多久

房屋侵占的适用诉讼时效是三年。我国法律规定，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。诉讼时效期间自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。但是，自权利受到损害之日起超过二十年的，人民法院不予保护，有特殊情况的，人民法院可以根据权利人的申请决定延长。

《中华人民共和国土地管理法》（2019修正）：第二章　房地产开发用地 第一节　土地使用权出让　　第十四条　土地使用权出让最高年限由国务院规定。