1、参保对象不同：农村合作医疗保险的参保对象是农村户口居民，社保参保对象为在职职工或城镇居民

2、保障期限不同：农村合作医疗保险是交一年保一年，社保中的医疗险是要求持续缴纳最少15年才可以享受终身医保待遇

3、报销比例不同：农村合作医疗保险报销比例较低，而社保中的医疗保险报销比例较高

4、有无个人医保账户：农村合作医疗保险是没有个人医保账户的，社保中的医疗保险有个人医保账户。

一、医保和社保有什么区别呢？

1、概念不同：

社保卡就是社会保障卡，是由各地人力资源和社会保障部门面向社会发行，用于人力资源和社会保障各项业务领域的集成电路卡。

医保卡是医疗保险个人账户专用卡，以个人身份证为识别码，储存记载着个人身份证号码、姓名、性别以及账户金的拨付、消费情况等详细资料信息。

2、功能不同：

社保卡不仅具有医保卡功能，还是办理各项社保业务的重要凭证，例如领取失业金等等。

医保卡仅限于医保功能，只能用来享受医保待遇。

3、发卡部门不同：

医保卡由当地指定代理银行承办。

社保卡由各地人力资源和社会保障部门面向社会发行。

4、安全性能不同：

社保卡有较为严格的密钥管理体系和审批，安全系数较高。

医保卡则没有这种管理体系，安全系数较低。

二、城乡医保和新农合是一样的吗

城乡医保和新农合不一样。

新农合属于卫生系统管，而城镇医保属于社保系统管，两个系统不一样。

城镇居民医疗保险是以没有参加城镇职工医疗保险的城镇未成年人和没有工作的居民为主要参保对象的医疗保险制度。它是继城镇职工基本医疗保险制度和新型农村合作医疗制度推行后，党中央、国务院进一步解决广大人民群众医疗保障问题，不断完善医疗保障制度的重大举措。它主要是对城镇非从业居民医疗保险做了制度安排。这一制度的出现在中国社会保险制度改革的历程中具有重大意义，指明了中国社会保险制度改革的方向。

新型农村合作医疗（简称“新农合”）是指由政府组织、引导、支持，农民自愿参加，个人、集体和政府多方筹资，以大病统筹为主的农民医疗互助共济制度。其采取个人缴费、集体扶持和政府资助的方式筹集资金。农村合作医疗保险是由我国农民（农业户口）自己创造的互助共济的医疗保障制度，在保障农民获得基本卫生服务、缓解农民因病致贫和因病返贫方面发挥了重要的作用。参加新农合而言，很多人都是在外打工或做生意，很多都无城镇医保，故只有合作医疗现实，但却要在户籍地参加新型农村合作医疗，不能在居住地交。新型农村合作医疗制度是以大病统筹兼顾小病理赔为主的农民医疗互助共济制度。这个定义显示出新型农村合作医疗制度是救助农民的疾病医疗费用的而门诊、跌打损伤等不在该保险范围内，这项规定使得农民实际受益没有预想的那么大。