劳动者旷工三天自离，劳动者和用人单位不一定解除劳动关系，实践中，劳动者自离的，用人单位会依法向劳动者寄送解除劳动合同通知书和解除劳动合同证明，在15日依法到用人单位所在地的社保局办理减员手续，终止劳动者和用人单位的权利和义务。劳动者没有回原用人单位办理离职手续的，用人单位可能会扣发劳动者的合法工资，劳动者回原单位依法办理；离职手续的，用人单位应当依法支付劳动者的合法工资。

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一、旷工三天被开除合法吗

1、旷工三天被开除是否合法，需要视情况而定：

（1）要看单位是否有规章制度，该制度是否明确规定，旷工三天屋于严重违反公司规章，该规章是否经过工会或职工代表讨论通过，该规章是否公告或送达。该公司可以解除合同并不予补偿；

（2）如果公司制度中没有该规定，就不合法。

2、法律依据：《中华人民共和国劳动合同法》第三十九条

【用人单位单方解除劳动合同（过失性辞退）】劳动者有下列情形之一的，用人单位可以解除劳动合同：

（一）在试用期间被证明不符合录用条件的；

（二）严重违反用人单位的规章制度的；

（三）严重失职，营私舞弊，给用人单位造成重大损害的；

（四）劳动者同时与其他用人单位建立劳动关系，对完成本单位的工作任务造成严重影响，或者经用人单位提出，拒不改正的；

（五）因本法第二十六条第一款第一项规定的情形致使劳动合同无效的；

（六）被依法追究刑事责任的。

二、有哪些情形之一的，用人单位提前三十日以书面形式通知劳动者本人或者额外支付劳动者一个月工资后，可以解除劳动合同

1、劳动者患病或者非因工负伤，在规定的医疗期满后不能从事原工作，也不能从事由用人单位另行安排的工作的；

2、劳动者不能胜任工作，经过培训或者调整工作岗位，仍不能胜任工作的；

3、劳动合同订立时所依据的客观情况发生重大变化，致使劳动合同无法履行，经用人单位与劳动者协商，未能就变更劳动合同内容达成协议的。

《中华人民共和国劳动合同法》第五十条用人单位应当在解除或者终止劳动合同时出具解除或者终止劳动合同的证明，并在十五日内为劳动者办理档案和社会保险关系转移手续。劳动者应当按照双方约定，办理工作交接。用人单位依照本法有关规定应当向劳动者支付经济补偿的，在办结工作交接时支付。用人单位对已经解除或者终止的劳动合同的文本，至少保存二年备查。