一是组织形式不同。债券基金是由基金管理公司和托管人负责募集的，用于投资一揽子债券的集合理财产品;具体债券则只是由某个发行人承诺按某一期限安排支付利息和本金的合约。

二是交易对象不同。债券基金投资者可以通过银行、证券公司或直接向基金管理人申购和赎回份额;债券投资者则必须通过银行、证券公司、证券交易所来购买具体债券。

目前，个人可投资的债券品种主要有凭证式国债、记账式国债、凭证式或记账式企业债(目前对普通投资者发行的凭证式企业债很少)、可转换公司债，但不能买卖银行间市场交易的国债和金融债。而投资债券基金，就可以通过债券基金买到许多利率较高的企业债，也可以进入银行间债券市场去买卖在那里交易的金融债和国债，获取更高的收益。

资料显示，近年短期融资券、公司债、可分离债等新品种的大量涌现，为债券基金提供了更大的操作空间，虽然这些品种存在一定的信用风险，但这恰恰是专业投资机构所能把握的领域。基金公司利用自己的专业水平，有效识别企业的信用风险，利用信用市场上的误定价，来获取超额收益。

三是多样化程度不同。债券和债券基金的主要风险是利率风险，而不同期限的债券对利率的敏感度不同，长期债价格受利率变化影响较大，假如出现利率上升，长期债的价格就会下降而使债券的持有人遭受损失。因此，通过对不同种类和期限结构的债券品种进行投资组合，可以较单只债券创造更多的潜在收益。

此外，目前许多的债券仅限于在银行间债券市场流通，意味着即使投资者有足够的购买意愿和承担能力，也并不一定可以买到自己想投资持有的债券。

四是现金流收入的规模和时间安排不同。债券基金合同既可以约定到点分红，又可以约定为视收益状况分红，其现金流规模不确定;而债券还本付息的具体数目和日期都是既定的。

五是流动性不同。投资债券基金比投资单只债券具有更好的流动性。债券基金的投资者可以在任意开放日按照净值减去相应费用的价格赎回基金份额;而一般债券是根据期限到期偿还的。

六是持有期成本不同。债券基金投资者需要付出管理费、托管费、交易手续费等投资成本;债券投资者则可能仅需要支付一次交易手续费，但债券投资者一旦急需用钱，则要通过二级市场交易才能卖出未到期的债券，且卖出的手续费相对较高。

七是再投资难易程度不同。债券基金的投资者可以轻松安排收益或者本金的再投资;债券投资者如想再投资，既需满足市场的最低资金要求，又需要找到市场的有效供给。

八是期限不同。债券基金存续期不固定;债券有明确具体的到期日。