一、拆迁协议是与哪个部门签订

依据我国相关法律的规定，房屋拆迁补偿协议是由房屋征收部门与被征收人，依照国有土地上房屋征收与补偿条例的规定签订的。

《国有土地上房屋征收与补偿条例》

第二十五条房屋征收部门与被征收人依照本条例的规定，就补偿方式、补偿金额和支付期限、用于产权调换房屋的地点和面积、搬迁费、临时安置费或者周转用房、停产停业损失、搬迁期限、过渡方式和过渡期限等事项，订立补偿协议。

补偿协议订立后，一方当事人不履行补偿协议约定的义务的，另一方当事人可以依法提起诉讼。

二、签订拆迁补偿协议时要注意什么问题

1、补偿没谈好千万不要轻易签字，否则签完协议之后才发现补偿不合适，维权难度就很大了。

2、审查签订合同的主体是否具有合法的资格。也就是搞清楚您跟谁签订的拆迁补偿协议，这个单位是否有权利与您签订协议，有没有履行协议的能力，如果签订的主体没有资格、不合法，将来极有可能无法履行协议，给您带来巨大损失。

3、安置补偿的各项内容是否约定清楚。比如补偿款的总金额及各项补偿内容的具体明细，补偿款的支付时间及支付式，安置房的位置、房号，安置土地的面积及具体位置、土地性质等等，千万不要轻信拆迁工作人员的话，签订内容约定不清的协议或空白协议。

4、明确约定合同履行的程序和违约责任。很多拆迁项目都要求合同签订后马上腾退房屋，在交房后才支付拆迁补偿款，这种约定对于被拆迁人来说风险是很大的。因此，我们签订协议时，一定要跟拆迁方约定好，如果不能按时支付补偿款或者按时安置房屋的补救措施和违约责任，避免到时候拆迁方任性违约。

三、达成拆迁补偿安置协议后房屋拆迁纠纷的处理方式

房屋拆迁补偿安置协议是约定房屋拆迁当事人之间民事权利和义务关系的合同。

拆迁补偿安置协议签订后，被拆迁人或者房屋承租人在搬迁期限内拒绝搬迁的，应当通过司法、仲裁途径来解决。如果拆迁当事人之间没有达成仲裁协议的，拆迁人可以向人民法院提起民事诉讼。诉讼期间，拆迁人可以依法申请人民法院先予执行。如采取仲裁方式，拆迁当事人必须自愿达成仲裁协议。仲裁协议包括房屋拆迁补偿安置协议中订立的仲裁条款和以其他方式在纠纷前或纠纷后达成的请求仲裁的协议。仲裁委员会的选择由当事人协议确定。仲裁实行一裁终局制。裁决作出后，当事人就同一纠纷再申请仲裁或者向人民法院起诉的，仲裁委员会或者人民法院不予受理。

没有仲裁协议的，一方申请仲裁的，仲裁委员会不予受理；当事人达成仲裁协议的，一方向人民法院起诉的，人民法院不予受理。