主要区别有：

1、行为方式不同：从行政确认的行为方式来看，既有依申请的确认，也有依职权的确认，而行政许可只能是依申请的行政行为。

2、法律效果不同：行政确认是对相对人是否具有某种法律地位、法律关系以及法律事实是否存在的宣告，行政确认本身并不直接设定行政相对人权利义务，也不会直接导致行政相对人权利义务变更或消灭；而行政许可直接设定了行政相对人的权利义务，产生了直接的法律效果。

3、所针对的事项不同：行政确认针对的是某种事实、资格或权利义务关系。对是否存在、是否具备和权利义务处于何种状态作出判断。行政许可针对的只能是行为，也就是说只能对行为进行限制或禁止。

关于行政确认的基本认识

（一）行政确认的概念和特点

行政确认是行政主体依法，依行政相对人的申请或依职权，对一定的法律事实、法律关系、权利、资格或法律地位等进行认定、甄别、证明并予以宣告的行政行为。它具有以下法律特征：

1．行政确认通常是依申请的行政行为，行政相对人提出申请，行政主体才能对申请事项进行确认。但也有依职权作出的行政行为。

2．行政确认是一种外部的具体行政行为，它由申请、受理、审查、确认等一系列程序性要素组合而成，并由此构成一个完整的行政确认行为。

3．行政确认是一种要式行政行为，行政主体作出确认行为时必须以书面形式为之，并要符合一定的技术要求。

4．行政确认是羁束行政行为，行政主体进行行政确认时，应严格按照法律规定和技术规范进行操作，并尊重客观事实，做到以事实为根据，以法律为准绳，对行政法律规范和适用很少有选择余地的行政行为，也就是说可以进行较窄幅度的裁量，但非完全不能裁量。

5．行政确认是具有法律效力的行为，这种法律效力具体体现为确定力、证明力、不可撤销力。

6．行政确认的外在表现形式往往以技术鉴定书等形式出现，在较大程度上受技术规范的制约，并由此决定行政相对人的法律地位和权利义务。

（二）行政确认的主要形式和基本分类

行政确认的主要形式有确定、认可、证明、登记、批准、行政鉴定等。依据受理内容的不同，行政确认可做出如下分类：

1．对法律上主体资格、身份及法律地位的确认；如通过药品经营企业登记对企业经营主体资格的确认。

2．对权属的确认，如土地所有权、使用权的确认；对房屋所有权的确认等。

3．对法律关系的确认，如婚姻登记就是对合法有效的婚姻关系的确认。

4．对法律事实的确认，如出租车出城登记就是对出租车驾驶出城这一法律事实的确认。

5．对法律责任的确认，如医疗事故鉴定、交通事故的认定等。

6．对能力的确认，如技术鉴定即是对个人是否具有从事某种行为的能力的确认。

7．对行为的法律效力的确认，如复议机关撤销被提起复议的行政处罚就是对该行政处罚违法性的确认。

《中华人民共和国行政许可法》第二条本法所称行政许可，是指行政机关根据公民、法人或者其他组织的申请，经依法审查，准予其从事特定活动的行为。