一，客体不同。非法占用农用地罪侵害的是国家对土地特别是耕地进行保护的管理制度;而非法占用林地罪侵害的则是国家对进行保护的管理制度。

二，客观方面不同。非法占用耕地罪在客观上表现为违反土地管理法规，非法占用耕地改作他用，数量较大，造成耕地大量毁坏的行为;非法占用林地的行为通常表现为三种形式：

(1)未经批准占用林地，即未经国家土地管理机关审核，并报经人民政府批准，而擅自占用林地;

(2)超过批准的数量占用林地，即少批多占林地的，其中一部分林地的占用经过合法批准，一部分林地的占用则未经批准;

(3)采取欺骗手段骗取批准占用林地，主要是以提供虚假文件、谎报用途或借用、盗用他人的名义申请等欺骗手段取得批准手续而占用林地。

三，对二者的处罚规定不同。

一、哪些要素会构成非法占用土地罪?

以下要素会构成非法占用土地罪：

一）主观要件：在主观方面表现为故意；

（二）主体要件：主体为一般主体；

（三）客体要件：侵犯的客体是国家的耕地管理制度；

（四）客观要件：在客观方面表现为违反土地管理法规，非法占用耕地改作他用，数量较大，造成耕地大量毁坏的行为。

二、非法占地如何处罚

非法占地处罚如下：

1、责令退还非法占用的土地。

即将非法占用的土地恢复到占用以前的状态，如果非法占用的土地是公共用地或未确定给单位和个人使用的国有土地的，要恢复到占用以前的原貌；如果非法占用的土地是其他单位和个人使用的国有土地的，要将非法占用的土地退还原使用者，由此而给原使用者造成损失的，可以依法追究违法使用者的民事责任；如果非法占用的土地是农民集体经济组织的，作出处罚决定的土地行政主管部门应当责令其交还原农民集体经济组织；

2、限期拆除新建的建筑物和其他设施。

如果在非法占用的农用地上新建了建筑物和其他设施的，并且这些建筑物和其他设施是违反土地利用总体规划的，作出处罚决定的土地行政主管部门应当责令违法者在一定期限内予以拆除，恢复土地原状；

3、没收新建的建筑物和其他设施。

如果在非法占用的土地新建的建筑物和其他设施是符合土地利用总体规划的，作出处罚决定的土地行政主管部门应当予以没收；

4、罚款。

对非法占用土地的，除采取上述处罚措施以外，还可以对当事人处以罚款，但罚款是选择性适用条款，是否给予罚款，由土地行政主管部门根据违法情节而定，至于罚款的具体幅度和标准，应由《土地管理法实施条例》作出明确规定；

5、行政处分。

给予行政处分的对象是非法占地单位的直接负责的主管人员和其他直接责任人员。给予行政处分的依据是《国务院关于行政机关工作人员奖惩暂行规定》和《企业职工奖惩条例》。行使行政处分的机关是有关责任人员的所在单位或者上级机关。

6、刑事责任。

违反土地管理法规，非法占用耕地、林地等农用地，改变被占用土地用途，数量较大，造成耕地、林地等农用地大量毁坏的，构成非法占用农用地罪，处五年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处罚金。