主要难在三个方面：劳动关系的认定、工伤赔偿的主体确定、民工法制观念淡薄。

第一，证明自身与工作单位的劳动关系是进行工伤认定的首要条件，若是连劳动关系都无法证明，工伤认定将无法进行。但是现实生活中很多用人单位用人不规范，劳动者又没有相关的意识保留证据，导致劳动关系认定十分困难。

第二，工伤赔偿主体的确定也是非法用工市场工伤认定的一大难题。按照现行《劳动法》规定，用人单位必须首先具备用人资质，即必须是用人单位而非个人。但现实中，大量没有营业执照而以用人单位名义招用农民工的非法用工主体大量存在。

第三，民工法制观念淡薄，为工伤认定带来了诸多不利。由于自身法制观念淡薄，许多民工在发生工伤事故后，或与用人单位私了；或一拖再拖，延误了工伤认定的时机；或为了保住工作，选择忍气吞声。结果是便宜了包工头，害苦了自己。

一、申请工伤时公司是空壳该怎么办

对于劳动者，处理工伤应按如下步骤进行：第一步，要求用人单位垫付医疗费，进行治疗。注意尽量不要自己垫付医疗费，否则以后处理工伤，无论是协商解决还是打官司都非常的被动；第二步，收集劳动关系的相关证明，这一点相当关键。劳动关系证明材料是申请工伤认定的必备材料，没有劳动关系证明，将无法启动下一步的工伤认定程序；没有劳动关系证明，不要轻易启动工伤认定程序，否则也可能使自己处于非常被动的局面；第三步，进行工伤认定。工伤认定是由人力资源和社会保障部门对所受伤害是否属于工伤进行的行政确认，是处理工伤最为重要的一步。如果单位认可是工伤，劳动者可以建议用人单位去申请工伤认定。需要注意的是，第一、只有人力资源和社会保障局有权力作出工伤认定，不要盲目相信企业认可工伤的承诺（注：极少数地区规定，没有参加工伤保险的，用人单位认可为工伤的，可以按工伤处理。）第二、自发生工伤事故或确诊职业病，最晚不要超过一年的时间去申请工伤认定。第四步，进行劳动能力鉴定。劳动能力鉴定也就是对工伤受伤程度进行伤残评定，由劳动能力鉴定委员会组织专家进行。第五步，申请劳动仲裁，索赔工伤待遇。根据鉴定的伤残等级以及《工伤保险条例》的规定，可以确定工伤赔偿的项目和工伤赔偿标准，可以与用人单位先行协商；协商不成的，向用人单位所在地或者劳动合同履行地的劳动争议仲裁委员会申请仲裁。对仲裁裁决不服的，可以向人民法院提起民事诉讼。

二、对工伤认定结果不服的怎么处理

劳动者对劳动行政部门作出的工伤认定结论不服的，应先向作出工伤认定结论的劳动行政部门的上级行政机关申请行政复议，对复议决定不服的，再向人民法院起诉。

《工伤保险条例》第五十五条的规定，申请工伤认定的职工或者其直系亲属、该职工所在单位对工伤认定结论不服的，有关单位和个人可以依法申请行政复议；对复议决定不服的，可以依法提起行政诉讼。注意保留相关证据。劳动者通过劳动保障监察、劳动争议仲裁、行政复议等法律途径维护自身合法权益，或者申请工伤认定、职业病诊断与鉴定等，都需要提供证明自己主张或案件事实的证据。

如果劳动者不能提供有关证据，可能会影响自身权益。因此，劳动者在平时的工作中应注意保留有关证据包括：

1、来源于用人单位的证据，如与用人单位签订的劳动合同或者与用人单位存在事实劳动关系的证明材料、工资单、用人单位签订劳动合同时收取押金等的收条、用人单位解除或终止劳动关系通知书、出勤记录等；

2、来源于其他主体的证据，如职业中介机构的收费单据；

3、来源于有关社会机构的证据，如发生工伤或职业病后的医疗诊断证明或者职业病诊断证明书、职业病诊断鉴定书、向劳动保障行政部门寄出举报材料等的邮局回执；

4、来源于劳动保障部门的证据，如劳动保障部门告知投诉受理结果或查处结果的通知书等。

《工伤保险条例》第十八条规定，提出工伤认定申请应当提交下列材料：

（一）工伤认定申请表；

（二）与用人单位存在劳动关系（包括事实劳动关系）的证明材料；

（三）医疗诊断证明或者职业病诊断证明书（或者职业病诊断鉴定书）。