玩忽职守罪与重大事故罪的区别如下：（1）犯罪客体不同。玩忽职守罪侵犯的是国家机关的正常管理活动；而重大责任事故罪侵犯的是工厂、矿山、林场等企业、事业单位的生产安全。（2）犯罪的行为方式不同。在玩忽职守犯罪中，行为人表现为消极地不履行自己的法定职责，或者不认真履行自己的法定职责；而在重大责任事故犯罪中，行为人表现为不服管理、违反规章制度，或者实施了强令工人违章冒险作业行为。（3）犯罪主体不同。玩忽职守罪的犯罪主体只能是国家机关工作人员，；而重大责任事故罪的犯罪主体是工厂、矿山、林场等企业、事业单位的职工。

本罪与玩忽职守罪的界限是怎么样的？

所谓玩忽职守罪，是国家机关工作人员玩忽职守，致使公共财产、国家和人民利益遭受重大损失的行为。玩忽职守罪在犯罪主体、侵犯客体、行为表现内容等方面均有别于擅离、玩忽军事职守罪。具体表现为如下方面：

（一）侵犯的客体不同。玩忽职守罪所侵犯的客体是国家机关的管理活动，而本罪侵犯的客体限定为国家军事机关的管理活动。

（二）客观行为表现不同。玩忽职守行为指国家机关工作人员不履行或者不正确履行职责，而本罪表现为私自脱离军事指挥、值班、值勤岗位或者对上述岗位不负责任，不履行或者不正确履行其军事指挥、值班、值勤职责。

（三）犯罪主体不同。玩忽职守罪的主体是国家机关工作人员；本罪的主体是负有指挥、值班、值秘责任的军人。

综合上面所说的，擅离、玩忽军事职守的行为是扰乱了我国．军事机关的管理活动，只要造成严重的后果就会承担起刑事的责任，对于处罚的标准就需要承担三年以下的有期徒刑；所以，对于不同的案件所存在的处理方式就会完全不一样。

《中华人民共和国刑法》第三百九十七条国家机关工作人员滥用职权或者玩忽职守，致使公共财产、国家和人民利益遭受重大损失的，处三年以下有期徒刑或者拘役；情节特别严重的，处三年以上七年以下有期徒刑。本法另有规定的，依照规定。国家机关工作人员徇私舞弊，犯前款罪的，处五年以下有期徒刑或者拘役；情节特别严重的，处五年以上十年以下有期徒刑。本法另有规定的，依照规定。第一百三十四条工厂、矿山、林场、建筑企业或者其他企业、事业单位的职工，由于不服管理、违反规章制度，或者强令工人违章冒险作业，因而发生重大伤亡事故或者造成其他严重后果的，处三年以下有期徒刑或者拘役；情节特别恶劣的，处三年以上七年以下有期徒刑。