药品配方申请专利的主要弊端在于专利申请原则是以公开换保护，申请人就配方申请了专利之后也就意味着配方必须公开。就算把里面的一些数据做了模糊化处理，竞争对手往往仍然可以通过逆推手法加上公开的零碎信息推断试验出配方，然后在你的配方基础上做出修改或者衍生出新的配方，从而制造产品来与你竞争。

另一个原因应该就是我国发明专利申请的期限并不是永久的，发明专利的保护期限仅为20年，且不能续费延期，显然配方专利申请并不是一个一劳永逸的事情。一旦超出专利保护期，将秘方申请专利的意义也就不复存在了。

一、药品配方能申请专利吗

可以肯定地说，中药、中草药的配方、偏方、古方是可以申请专利的。不过，申请药品配方专利必须要公开的配方组份及比例，否则就不能被授权。申请前必须谨慎，如果公开的结果对你不利，还是不要申请专利的好。否则，就可以申请专利。

对于药品的配方发明专利，在知识产权的定义上来讲，应该先对配方专利技术得到专利法的相关保护，专利是按照先申请先得的原则，您申请专利以后可以向您所在的当地政府申请专利的资助或是奖励，你申请了专利保护以后对您的配方技术也会有专利保护的保障。申请专利可以自己递交到国家知识产权局或委托正规注册的代理机构，因为专利撰写的好坏涉及到保护的到不到位，建议还是委托代理机构处理。发明专利对专利的技术含量相对较高，其文件准备也是相当重要的，文件的质量会直接影响到您专利的保护力度及专利的保护范围。

当然，也有一部分中药、中草药的配方、偏方、古方根据专利法的要求是不能被授予药品专利的，这些不能授予药品专利的有几下几种情况：

1、专利申请的药物不具备医疗效果或医疗效果不可信。有的申请在说明书和权利要求书当中，从未公开过所申请药物的功用，只是给出了药物的组成和制法，这种申请由于该药物不具有医疗作用而无使用价值，不具备实用性；如果所申请的药物其医疗效果不可信，申请人也没有可信性的证据证实专利申请药物的确切医疗效果，这种情况下，该申请的药物因不具备医疗效果而不具备实用性。

2、专利申请的药物，其原料中存在不能工业化生产或不能大批量再现的物质。如果申请的是一种产品，那么该产品必须在产业中能够制造。专利申请的药物，如果其制备原料当中的某些成分只适合于手工制作，或者其产量很低，根本不能够进行产业化规模生产，这种产品不具各实用性。

3、专利申请中的药物，其效果可能有损公共利益。

4、专利申请中的药品制备方法只限于手工操作，不适合于工业化生产。

请您参照以上意见查看自己的药品配方是否能够排除上述所有情形。另外，因药品专利申请需要提供大量实验数据，建议您先向国家药品监督管理局申请新药审批，以获得数据上的支持。

二、药品配方保护的一般做法

那么我们究竟应该如何保护药品配方呢？专利并非保护药品行业知识产权的唯一办法。一般来说，业内常用商业秘密的方法来保护他们的秘方。

用商业秘密的话，一般发明者不会告诉内部员工这些食物怎么生产，员工们也会签相关协议，以防止他们向外界泄露相关秘方。

另一方面，利用商业机密来保护的话，使得一些商家可以借此为噱头开拓市场。