内部转让股权应当缴纳个人所得税以及印花税，或是转让方或者是受让方是法人的话，还应当缴纳企业所得税。根据相关法律规定，印花税是合同的双方都需要缴纳的。

一、股东变更时要办理哪些手续？

股东、股权变更为800元人民币，所需材料：营业执照正副本原件、代码证正、副本及卡原件税务证正、副本原件公章、法人章新、老法人及股东、本人带好身份证原件(到工商所核对身份）签字材料。

同时，当事人还应按照法律规定纳税：

1、营业税。以前，以不动产入股的，转让过程中需要缴纳营业税的。而根据国家税务部门在2002年发布的最新规定，股权转让不再征收营业税。

2、企业所得税。按照国家规定，股权转让属于企业间进行的，出让与转让双方都需要缴纳企业所得税。

3、个人所得税。在公司股权转让过程中，获得收益的是个人的话，要按20%的税率缴纳个人所得税。

4、印花税。企业经营过程中，涉及到股份转让的，需要按照规定交易印花税。各地工商行政部门收取的费用存在差异，建议各位实际办理前，致电相关部门核实具体费用。

二、公司股权纠纷该怎么处理

公司股权纠纷处理方式如下：

1、公司股权纠纷可以通过和解或者调解解决；

2、当事人不愿和解、调解或者和解、调解不成的，可以根据仲裁协议向仲裁机构申请仲裁；

3、仲裁也无法纠纷的，当事人可以向法院提起民事诉讼。

公司股权转让要交的税金如下：

1、股权转让不需要缴纳营业税；

2、企业所得税，其取得的投资所得应按规定还原为税前收益后，并入投资企业的应纳税所得额；

3、印花税，按照产权转移就股权转让书据计贴印花税；

4、个人所得税，按股权转让所得缴纳个人所得税。

三、小公司变更股东要交税吗

需要。公司股东变更，首先必须缴纳股权转让印花税，如果公司有盈利自然人股东还要就盈利部分缴纳个人所得税。自然人股权转让行为，转让方需要按“财产转让所得”计征个人所得税，如果转让方以原价转让的，不交个人所得税。股权转让的双方要按万分之五税率缴纳印花税，对于股权转让所得，如果股东是自然人，要按20%税率缴纳个人所得税，如是法人股东，要按25%税率缴纳企业所得税。股东出让股权，一般来讲公司权益没有变化，企业一般不用缴纳所得税。