对建设工程合同纠纷案件进行举证的证据包括：建筑公司工商登记资料；招标文件、中标通知书；建设工程施工合同、施工过程中增减工程量的补充合同；工程预、决算报告、支付工程款的付收款凭证；工程验收、结算凭证、质检报告等。

一、如何预防拖欠工程款？

1、工程款支付时间应明确

对于预支款，应严格按照示范文本的规定，开工前七日内支付，否则施工企业有权停工。对于工程进度款应留意两个题目：一是工程进度款的计算，一般规范的作法是施工人按专用条款的约定向工程师提交已完工程量的报告，工程师在七日内应当核定，七天内不予核实的，施工人开列的工程量视为被认可。二是工程进度款的支付。规范的作法是双方确认计量结果后14天内，发包人应向施工人支付工程款，逾期不支付，又不能达成延期付款协议，导致施工无法进行，承包方可停止施工。

2、逾期支付的法律后果应具体

根据《建设工程施工合同（示范文本）》的约定，有关赔偿承包人的损失的计算方法或者发包人支付违约金的数额或计算方法应在专有条款中约定。比如说可以约定发包人逾期支付工程款的，可以约定逾期一日应按逾期金额的1％支付违约金。

3、工程结算款支付与分部分项工程或施工人承包工程竣工挂钩

一般建筑工程施工合同中约定，工程竣工验收后发包人支付工程结算款，但是全部工程验收还是承包方的施工部分竣工验收并不明确，有时发包方往往声称由于部分工程（往往是一些小的扫尾工程）未完工，无法组织工程竣工验收，而不支付早已完工的分部分项工程的工程结算款。

二、工程量超出合同部分怎么处理

工程量超过合同约定的，当事人对超出部分有争议的，当事人可以自行协商处理，协商不成的，按照施工过程中形成的签证等书面文件确认。

《最高人民法院关于审理建设工程施工合同纠纷案件适用法律问题的解释(一)》

第十九条当事人对建设工程的计价标准或者计价方法有约定的，按照约定结算工程价款。

因设计变更导致建设工程的工程量或者质量标准发生变化，当事人对该部分工程价款不能协商一致的，可以参照签订建设工程施工合同时当地建设行政主管部门发布的计价方法或者计价标准结算工程价款。

建设工程施工合同有效，但建设工程经竣工验收不合格的，依照民法典第五百七十七条规定处理。

第二十条当事人对工程量有争议的，按照施工过程中形成的签证等书面文件确认。承包人能够证明发包人同意其施工，但未能提供签证文件证明工程量发生的，可以按照当事人提供的其他证据确认实际发生的工程量。

三、发生纠纷，施工合同已备案为准对吗

如果有发生纠纷，特别是工程款纠纷时，施工方以经过中标备案的合同为依据。理由是依据最高人民法院《关于审理建设工程施工合同纠纷案件适用法律问题的解释》第21条“当事人就同一建设工程另行订立的建设工程施工合同与经过备案的中标合同实质性内容不一致的，应当以备案的中标合同作为结算工程价款的根据”。

实际上，《关于审理建设工程施工合同纠纷案件适用法律问题的解释》第21条所规定的以备案合同为依据并非绝对。从司法实践当中来看，如果建设方和施工方签订的两份合同版本不同，那么应当以备案的为准；反之，如果双方签订的两份合同版本相同，那么应当根据实际情况确定，如果私下签订的建设工程施工合同体现双方的真实意思，例如，变更了备案的建设工程施工合同，那么就应当以私下签订的建设工程施工合同为准，而不依据备案的建设工程施工合同。