有限责任公司确认股权可以通过股东名册，出资证明书以及公司章程等方式确认。而不能以工商登记确认，因为登记是可以对抗善意第三人，而不是股东权利的生效要件。

一、公司转让费用股权转让代理费吗

1.向股东以外的第三人转让股权的，由转让股权的股东向公司董事会提出申请，由董事会提交股东会讨论表决;股东之间转让股权的，不需经过股东会表决同意，只要通知公司及其他股东即可。2.双方签订股权转让协议，对转让股权的数额、价格、程序、双方的权利和义务做出具体规定。3.在转让股权过程中，凡涉及国有资产的，为防止国有资产流失，应进行资产评估。股权转让的价格一般不能低于该股权所含净资产的价值。4.对于中外合资或中外合作的有限公司股权转让的，要经中方股东的上级主管部门同意，并报原审批机关审批同意以后方可办理转让手续。5.收回原股东的出资证明书，发给新股东出资证明书，对公司股东名册进行变更登记，注销原股东名册，将新股东的姓名或名称、住所地及受让的出资额记载于股东名册，并相应修改公司章程。6.将新修改的公司章程、股东及其出资变更等向工商行政管理部门进行工商变更登记。至此，有限责任公司股权转让的法定程序才告完成。

二、股权变更日期怎么算

有限责任公司的股权转让应从变更股东名册起生效。股东转让出资后，可能出现股东名册与公司记载之间不一致的情况，对此公司应当及时办理变更登记，保持股东名册与公司登记之间的一致性。如果没有经过登记，或者没有及时办理变更登记，则不得对抗第三人，即第三人通过受让出资等方式成为公司股东并记载于股东名册后，如果没有在公司登记机关办理相关登记的，不能主张该第三人的股东资格无效。

三、股权转让流程是怎样的

办理流程为：1、当事人应当签订股权转让协议；2、股权转让后，公司必须注销原股东的出资证明书，然后向新股东签发出资证明书；3、公司应当修改公司章程，以及对股东名册作出修改；4、最后再去公司登记机关办理股东变更登记，未办理登记的，新股东就不可以对抗善意的第三人，以免原股东再次转让股权。