1.两罪主体不同。交通肇事罪的主体是指一切直接从事交通运输和保证交通运输的人员以及非交通人员。重大责任事故罪的主体范围较广，既包括对生产作业负有组织、指挥或者管理职责的负责人、管理人、实际控制人、投资人等人员，还包括以及直接从事生产作业的人员。这意味着在交通运输领域，如果触犯了重大责任事故罪，除直接从事交通运输的人员，对交通运输生产作业负有组织、指挥、管理、控制的相关人员均可能涉嫌犯罪。2.除航道、道路交通领域外，其他公共交通领域发生重大事故不会同时触犯两罪。在航道、公路等公共交通领域，违反交通运输法规驾驶机动车辆或者其他交通工具，发生重大事故构成犯罪的，应认定为交通肇事罪；在停车场、修理厂、农耕田地等非公共交通领域，驾驶机动车辆或者其他交通工具，造成重大事故构成犯罪的，应具体情况具体分析，分别认定为重大责任事故罪、重大劳动安全事故罪、过失致人死亡罪等罪。3.一般而言，交通肇事罪要求行为人违反交通运输管理法规并产生危害结果，两者之间存在因果关系。重大责任事故要求行为人有违反有关安全管理规定的行为，且该行为发生与生产活动存在因果关系，是在生产过程中、与生产活动有直接联系，进而引起重大伤亡事故、严重后果。

一、过失损坏交通工具罪的认定标准

1、本罪与破坏交通工具罪的界限

过失损坏交通工具罪与破坏交通工具罪都是以交通工具为侵害对象的危害交通运输安全的犯罪。两者主要的区别是：

（1）主观罪过不同，过失破坏交通工具罪是过失犯罪。行为人对其行为可能引起的严重后果持否定态度，或者应当预见而未预见，或者虽已预见而轻信能够避免，以致引起严重后果。破坏交通工具罪是故意犯罪。行为人对其破坏行为会发生严重危害结果是明知的，并且持希望或者放任态度。

（2）对危害结果要求不同。前者把造成严重后果作为构成犯罪的法定要件，如果实施破坏交通工具的过失行为尚未造成严重后果，不构成犯罪。后者只要故意实施破坏交通工具的行为，并足以使之发生倾覆或毁坏危险，无论是否造成严重危害结果，均构成犯罪，而且构成破坏交通工具罪既遂。

2、本罪与交通肇事罪的界限

两者都是过失犯罪，主要区别在于客观方面不同。过失损坏交通工具罪主要表现为行为人因过失行为而致使火车、汽车、申力、船只、航空器发生倾覆、毁坏，造成严重后果；交通肇事罪则表现为行为人（包括从事交通运输的人员和非从事交通运输的人员，违反交通运输管理法规而引起重大事故，致人重伤、死亡或者使公私财产遭受重大损失。因此，如果交通运输人员在驾驶交通工具的过程中，违反交通运输管理法规，过失引起交通工具倾覆、毁坏，造成严重后果，则不构成过失损坏交通工具罪，而构成交通肇事罪。