在实践中，共益债务时常发生争议，主要有三种情形：

第一种情形是管理人与主张共益债权的债权人之间对共益债务存在与否或数额的多少发生争议；

第二种情形是其他债权人或职工对共益债务有异议;

第三种情形是债务人对共益债务有异议。

一、公司申请破产后债务怎么办

根据民事诉讼法规定，企业法人应按照下列顺序清偿债务：

1、破产费用。包括：破产案件的诉讼费用；管理、变价和分配债务人财产的费用；管理人执行职务的费用、报酬和聘用工作人员的费用。

2、共益债务，是指人民法院受理破产申请后，为了全体债权人的共同利益以及破产程序顺利进行而发生的债务。共益债务包括：

（1）因管理人或者债务人请求对方当事人履行双方均未履行完毕的合同所产生的债务；

（2）债务人财产受无因管理所产生的债务；

（3）因债务人不当得利所产生的债务；

（4）为债务人继续营业而应支付的劳动报酬和社会保险费用以及由此产生的其他债务；

（5）管理人或者相关人员执行职务致人损害所产生的债务；

（6）债务人财产致人损害所产生的债务。

3、破产财产在优先清偿破产费用和共益债务后，依照下列顺序清偿：

（1）破产人所欠职工的工资和医疗、伤残补助、抚恤费用，所欠的应当划入职工个人账户的基本养老保险、基本医疗保险费用，以及法律、行政法规规定应当支付给职工的补偿金；

（2）破产人欠缴的除前项规定以外的社会保险费用和破产人所欠税款；

（3）普通破产债权。此外，破产财产不足以清偿同一顺序额清偿要求的，按比例分配。

二、企业破产后债务清偿顺序

《企业破产法》(2007年6月1日起施行)第一百一十三条的规定：

(一)破产财产在优先清偿破产费用和共益债务后，依照下列顺序清偿：

(1)破产人所欠职工的工资和医疗、伤残补助、抚恤费用，所欠的应当划入职工个人账户的基本养老保险、基本医疗保险费用，以及法律、行政法规规定应当支付给职工的补偿金；

(2)破产人欠缴的除前项规定以外的社会保险费用和破产人所欠税款；

(3)普通破产债权。

破产财产不足以清偿同一顺序的清偿要求的，按照比例分配。

破产企业的董事、监事和高级管理人员的工资按照该企业职工的平均工资计算。

(二)破产费用

(1)破产案件的诉讼费用；

(2)管理、变价和分配债务人财产的费用；

(3)管理人执行职务的费用、报酬和聘用工作人员的费用。

(三)共益债务

(1)因管理人或者债务人请求对方当事人履行双方均未履行完毕的合同所产生的债务；

(2)债务人财产受无因管理所产生的债务；

(3)因债务人不当得利所产生的债务；

(4)为债务人继续营业而应支付的劳动报酬和社会保险费用以及由此产生的其他债务；

(5)管理人或者相关人员执行职务致人损害所产生的债务；

(6)债务人财产致人损害所产生的债务。

(四)债务抵消

进一步加大保护普通职工的利益，控制企业高级管理人员的薪资支付；《民事诉讼法》和《企业破产法》两者相比，《企业破产法》由于颁布时间晚，更适应中国经济情况的发展，其表述更为更为完善，更为具体。

据《破产法》40条：债权人在破产申请受理前对债务人负有债务的，可以向管理人主张抵销。但是，有下列情形之一的，不得抵销：

(1)债务人的债务人在破产申请受理后取得他人对债务人的债权的

(2)债权人已知债务人有不能清偿到期债务或者破产申请的事实，对债务人负担债务的，但是，债权人因为法律规定或者有破产申请一年前所发生的原因而负担债务的除外；

(3)债务人的债务人已知债务人有不能清偿到期债务或者破产申请的事实，对债务人取得债权的；但是，债务人的债务人因为法律规定或者有破产申请一年前所发生的原因而取得债权的除外。

三、破产清算后债务怎么清偿

破产清算后，企业应继续承担清偿责任，直至债务还清。清偿破产财产的顺序如下：

1、破产费用，破产费用包括：破产案件的诉讼费用、管理、变价和分配债务人财产的费用，管理人执行职务的费用、报酬和就业人员的费用。

2、共益债务，共同利益债务是指人民法院受理破产申请后，为全体债权人的共同利益和破产程序的顺利进行而发生的债务。

3、破产财产优先清偿破产费用和共益债务后，按顺序清偿：破产人欠职工的工资、医疗、伤残补助、抚恤金，应当划入职工个人账户的基本养老保险、基本医疗保险费，以及法律、行政法规规定应当支付给职工的补偿金；破产人欠缴的社会保险费用和破产人所欠税款除上述规定外；普通破产债权。