申请国家赔偿的确认违法案件由赔偿义务人的同级别人民法院进行管辖。

第二十条下列赔偿申请，由人民法院赔偿委员会按下列规定受理：

(一)赔偿义务机关为行使侦查、检察、监狱管理权的机关，赔偿申请人经依法申请赔偿并申请了复议，因对复议决定不服或者复议机关逾期不作决定的，由复议机关所在地的同级人民法院赔偿委员会受理；

(二)赔偿义务机关是区、县(市)人民法院，赔偿申请人对其不予赔偿的决定或赔偿数额有异议而提出申诉的，由其上一级人民法院赔偿委员会受理；

(三)赔偿义务机关为本市各中级人民法院或市高级人民法院的，由本市各中级或高级人民法院赔偿委员会受理。赔偿申请人对不予赔偿的决定或赔偿数额有异议而提出申诉的，由其上一级人民法院赔偿委员会受理；

(四)人民法院为共同赔偿义务机关之一，且共同赔偿义务机关逾期不予赔偿或赔偿申请人对赔偿决定有异议的，由共同赔偿义务机关中的人民法院的上一级人民法院赔偿委员会受理。

一、国家赔偿追责制度

《国家赔偿法》第十六条规定：赔偿义务机关赔偿损失后，应当责令有故意或者重大过失的工作人员或者受委托的组织或者个人承担部分或者全部赔偿费用。对有故意或者重大过失的责任人员，有关机关应当依法给予处分；构成犯罪的，应当依法追究刑事责任。目前，在《国家赔偿法》中，对什么是国家赔偿法的追责制度，没有明确定义和相关的司法解释。因此，在赔偿案件在实践中，往往难以适用。然而在国家赔偿案件中，赔偿义务机关赔偿工作人员，对当事人造成的损失可分为两大类。

一类是对有故意或者重大过失的责任人员给赔偿请求人的造成的直接财产损失。例如：内蒙呼格吉勒图国家赔偿一案，虽然此案再审被改判无罪，司法机关最终纠正了错案，正义得以申张。但是，接下来还需要让我们查一下当年办错案件的相关人员，是如何被问责，同时，更最重要的是必须查清，到底具体办案的相关人员究竟是疏忽大意，还是渎职犯罪。只有对相关责任人的疏忽错误一查到底，才能让办案人员彻底明白，避免草率敷衍，避免玩忽职守，最后只能是草菅人命。

另一类是因错捕、错判等出现的错案造成赔偿请求人限制人身自由和精神上的损害。又如：呼格吉勒图国家赔偿一案，被冤枉的人因为被错判，被错押，导致了他们经济上的损失及巨大的精神痛苦，国家赔偿就既有经济上的补偿，也有精神上的抚慰。给的钱再多也难抹平他们心里永远的伤痛，他们希望按照国家法律程序进行追责。

对第一类责任认定，对行政执法机关，一般是由赔偿义务机关或上级主管部门审查确认，还要由人民法院赔偿委员会确认；而对人民法院自赔案件，既要通过赔偿法院重新确认，最终还要经过赔偿委员会的审查。因此，对法院内部来说，冤、错案件一般是指人民法院工作人员在办案过程中故意违反与审判执行工作有关的法律法规致使裁判、执行结果错误，或者因重大过失违反与审判执行工作有关的法律法规致使裁判、执行结果错误，造成严重后果的案件。对冤、错案件追责，一旦经法院审判委员会或院长办公会议讨论确认定为错案后，办案法官将被移交到纪检部门接受问责或相关部门做出对错案的处理决定。

国家赔偿的案件一般是由同级别的人民法院审理，对于审理结果存在异议的民事主体，可以向当地的上一级人民法院提出上诉请求，但是若是此时不能提供新的证据，此时法院不会受理其请求，这是由于各地的司法资源是有限的。