股权确认纠纷案件所涉及的主要证据有：

1.股东名册，以公司股东名册的记载来确认股东的资格，得到了世界范围内公司法律的广泛认可；

2.公司章程，作为社团法人最为主要的象征之一；

3.出资证明书；

4.工商登记；

5.实际承受股东权利义务的行为。

一、公司转让的流程需要什么手续

1、股东会讨论表决；

2、资产评估；

3、签订转让协议；

4、收回原股东的出资证明书，给受让人发新的出资证明书，并记载于股东名册；

5、表决公司章程召开股东会议，表决修改公司章程，

6、工商登记注册就公司章程修改、股东及其出资变更、董事会和监事会的变更等向工商行政管理部门申请工商注册登记事项变更，

至此，完成了股东转让出资的全部法定程序。

二、股东持股确权是什么意思

股权确认实质上就是股东资格的确认。在设立公司的过程中会有许多法律文件对公司的股东身份、持股比例进行明确，成为公司股权确认的主要证据，如公司股东发起人协议、公司章程、出资证明书、股东会会议纪要、公司经营过程中形成的决议文件、公司股东名册、工商部门登记文件等，这些都可作为判断是否享有公司股权的证据。

三、股东凭证与股东资格取得是什么关系

股东资格又称股东地位，是指各民事主体作为公司股东的一种身份和地位。股东对公司的投资，必然要给予股东一定的凭证，有限责任公司表现为出资证书，股份有限公司则表现为股票。从性质上看无论出资证明书还是股票仅是物权凭证，是证明股东出资或持有股份的凭证。实践中出资者是否取得出资凭证不是认定其股东资格的必备要件。出资凭证仅仅是一种证明出资人已经出资的物权凭证，只是证明投资人是出资额或股份的合法所有人，并非证明投资人与公司之间存在某种成员关系，不能以出资证明书向公司主张股东资格和股东权利。即使没有出资凭证，只要出资者证明其已经按照公司章程或认购协议实际缴纳了出资，并登记在股东名册上，或工商登记中有记载，一般就可以认定其股东资格，不能以出资者不持有出资凭证而当然否认其股东资格，也不能以出资者持有出资凭证就认定其具有股东资格。