熟人强奸案证据不足的处理方法如下：

1、公安机关在侦查阶段证据不足的，可以依法进行补充侦查；

2、检察机关收到公安机关移送的材料后，认为故意伤害案件证据不足的，可以责令公安机关补充侦查，补充侦查后证据仍然不足的，可以作出不起诉的决定；

3、人民法院审理刑事案件后，如果证据不足的，可以宣告被告人无罪，并且当庭释放被告人。

一、审查起诉的相关法律规定是什么？

人民检察院审查案件，可以要求公安机关提供法庭审判所必需的证据材料；认为可能存在规定的以非法方法收集证据情形的，可以要求其对证据收集的合法性作出说明。

人民检察院审查案件，对于需要补充侦查的，可以退回公安机关补充侦查，也可以自行侦查。对于补充侦查的案件，应当在一个月以内补充侦查完毕。补充侦查以二次为限。补充侦查完毕移送人民检察院后，人民检察院重新计算审查起诉期限。对于二次补充侦查的案件，人民检察院仍然认为证据不足，不符合起诉条件的，应当作出不起诉的决定。

期限届满不能侦查终结的，经省、自治区、直辖市人民检察院批准或者决定，可以延长二个月：(一)交通十分不便的边远地区的重大复杂案件；(二)重大的犯罪集团案件；(三)流窜作案的重大复杂案件；(四)犯罪涉及面广，取证困难的重大复杂案件。

根据法律的规定，检察院可以将认定有错误或者证据不足的诉讼案件退回到公安机关进行重新侦查，在具体的司法实践中，对退侦的次数是有限制的，公安机关必须在规定的次数内完成诉讼案件的侦破，如果不能对犯罪事实进行认定，则需要根据相关规定的要求对犯罪嫌疑人进行释放。

二、审查起诉的结果有哪些

(一)、提起公诉

1、提起公诉的条件

犯罪事实清楚，证据确实、充分。

依法需要追究刑事责任。

2、起诉材料的移送

案卷材料和全部证据，包括犯罪嫌疑人、被告人翻供的材料，证人改变证言的材料，以及对犯罪嫌疑人、被告人有利的其他证据材料。

(二)、程序倒流

检察院对于公安机关移送审查起诉的案件，发现犯罪嫌疑人没有犯罪事实，或者符合刑诉法第15条规定的情形之一的，经检察长或者检察委员会决定，应当作出不起诉决定。

对于犯罪事实并非犯罪嫌疑人所为，需要重新侦查的，应当在作出不起诉决定后书面说明理由，将案卷材料退回公安机关并建议公安机关重新侦查。

公诉部门对于本院侦查部门移送审查起诉的案件，发现犯罪嫌疑人没有犯罪事实，或者符合刑诉法第15条规定的情形之一的，应当退回本院侦查部门，建议作出撤销案件的处理。

(三)、不起诉

证据不足不起诉应遵守如下规定：

检察院对于二次退回补充侦查的案件，仍然认为证据不足，不符合起诉条件的，经检察长或者检察委员会决定，应当作出不起诉决定。

检察院对于经过一次退回补充侦查的案件，认为证据不足，不符合起诉条件，且没有退回补充侦查必要的，可以作出不起诉决定。