1、专利和商业秘密都可以给企业带来经济利益，无法用专利法保护的，用商业秘密保护，一种是不属于专利法保护的客体，比如中医针灸方法；二是创造性高度不够，无法专利授权条件的，这两种情况用商业秘密保护。

2、对于公开后容易被竞争对手闹开的方案，用商业秘密保护，比如中药配方。

3、产品生命周期过长或过短的这种方案，不宜用专利保护。由于实用新型专利保护期限为十年，发明专利的保护期限为二十年，对于产品生命周期很长的技术方案，保护期限已过就进入公共领域，企业就无法在享有独占的权利，不如作为商业秘密保护，而专利的授权期限，需要至少半年，如果产品生命周期只是一个月以内，就没必要申请专利保护。

4、企业对科技成果的保护，既可以申请专利保护，也可以作为商业秘密来保护，但它们是两种截然不同的保护措施。

企业要善于根据对象的不同情况，选择不同的保护方式，不能一刀切。正是由于商业秘密中隐含着巨额利润，所以一些企业、公司和个人总是想方设法采取各种手段企图窃为已有。这也是现代商战中最为残酷无情的一幕。因此，权利人都要引以为戒，时刻警惕可能发生在自己身边的窃取商业秘密的活动。

一、专利和商业秘密的主要区别如下：

(一)专利和商业秘密的产生方式不同

专利必须通过申请，由国家授权后，才受到法律保护。商业秘密，则不需申请，更无须授权。权利人只要对其尚未公开的技术采取了保密措施，商业秘密便随即产生。

(二)专利和商业秘密的财产权性质不同

专利是一种完全的财产权，它具有独占性，谁首先申请专利并得到批准，谁就对这项技术享有专有权。未经专利人许可，其他人都不得使用。商业秘密的权利人则不具备这种独占性，商业秘密也不是一种完全的财产权，只要不是采用不正当手段获取的，同一项商业秘密，可以有若干权利人同时享有。

(三)专利和商业秘密受保护的时限不同

专利权的保护是有时间限制的，根据我国专利法的规定，发明专利权的期限为20年，实用新型专利权和外观设计专利权的期限为10年。专利保护期限届满后，该项技术不再受法律保护。商业秘密的保护是没有时间限制的，只要不被泄露或由权利人自行公开，可以一直受到法律的保护。

(四)专利和商业秘密的保护方式也不同

专利是通过技术公开和限制使用的方式对专利技术实施法律保护的。商业秘密则是通过采取保密措施，严格控制知悉范围的方式对专有技术实施保护的。由于保护的方式不同，适用的范围也有所区别。