根据相关法律规定，有两处（含）以上任职受雇单位并取得工资薪金收入，同一月份有两个（含）以上任职受雇单位同时扣除了每月5000元的减除费用，导致纳税人需要在今年汇算清缴时办理补税或退税。为纳税人减轻年度汇算期间的办税负担，现提示纳税人可选择在一处任职受雇单位扣除每月的减除费用，并告知其他单位不再扣除。

一、新个税下两份工资如何申报

1.同一月份存在两处以上工资薪金收入，任职单位按照现行个人所得税规定，以本单位发放的工资薪金所得来计算预扣预缴个人所得税，无需考虑其他任职单位。对于员工个人来说，应当核实两处以上工资薪金收入，办理个人所得税自行申报（即年终汇算清缴）。2.个人两处以上取的工资收入，不可以由一方单位代理合并申报纳税，该事项属于个人自行申报事项。3.现行政策，对于居民个人从两处以上取得工资、薪金所得没有要求按月合并申报，但综合所得年收入额减除专项扣除的余额超过6万元的，需要办理汇算清缴，申请补税和退税。

二、申请退税要满足什么条件

1、年度综合所得年收入额不足6万元，但平时预缴过个人所得税的。

2、年度有符合享受条件的专项附加扣除，但预缴税款时没有申报扣除的。

3、因年中就业、退职或者部分月份没有收入等原因，减除费用6万元、“三险一金”等专项扣除、子女教育等专项附加扣除、企业(职业)年金以及商业健康保险等扣除不充分的。

4、纳税人取得劳务报酬、稿酬、特许权使用费所得，年度中间适用的预扣率高于全年综合所得年适用税率的。

5、没有任职受雇单位，仅取得劳务报酬、稿酬、特许权使用费所得，需要通过年度汇算办理各种税前扣除的。

6、预缴税款时，未申报享受或者未足额享受综合所得税收优惠的。

7、有符合条件的公益慈善事业捐赠支出，但预缴税款时未办理扣除的等。

三、个人所得税有两个公司怎么办

纳税人两处以上取得工资、薪金所得的，应于取得所得的次月十五日内，选择并固定在其中一处任职受雇单位所在地的主管地税机关办理自行纳税申报；填制《个人所得税两处或两处以上工资、薪金所得纳税申报表》。薪金所得合并后，按税法规定的税率计算出应纳税额，送去单位发放时代扣代缴的个税额后，为自行申报补缴个税款。