毒品犯罪中使用的车辆是否作为作案工具没收是存在一定争议的，实践中一般认为如果是专门用于毒品犯罪的车辆，应当认定为作案工具予以没收，而主要用作其他使用如日常生活中代步工具，偶尔使用的，不认为是作案工具，应当予以返还。

一、贩毒案件存在证据“六难”

(1)证据线索发现难

贩毒案件尤其是零星贩毒案件，贩毒与吸毒人员之间通常采取使用交易暗号、运用电话手机等单线联系，双方都是贩毒活动的“受益者”，而不想暴露；无一般刑事案件的被害人，事主的报案，几乎无犯罪现场和痕迹留下，交易时一手交钱一手交货，时间短，不易发现；家庭化、同乡化、集团化的贩毒情况日渐增多，吸贩交织以贩养吸，有的已形成较为固定的供需网络。

(2)提取直接证据难

近年来跨地区、跨省的异地贩毒的现象突出，流动性大，贩毒人员常居无定所，多以出租屋为落脚点，利用假身份，“打一枪换一个地方”，查获证据难。作为贩毒案件核心的毒品不能缴获，除当场人赃俱获缴获毒品的贩毒事实易于取证外，其他贩毒事实特别是正在寻找买方，准备交易之时被抓获，身上未缴获毒品的案件证据难以收集。

(3)固定贩毒嫌疑人供述难

贩毒嫌疑人对其贩毒的时间、地点、参与人员、数量等最为清楚，可以提供确切的证据线索，是贩毒案件的重要证据。但其对贩毒事实往往避重就轻、避实就虚，存在着较大的虚假性；多数嫌疑人作案次数多，时间长，易有反复性，甚至出现前后供述自相矛盾的现象，致证据不稳定；嫌疑人为逃避罪责，在庭审中翻供的情况时有发生，其供述真伪难辩，难以固定。

(4)形成证据锁链难

有不少贩毒案件是在毒品交易尚未终了时被破获，涉及嫌疑人上线的证据，交易对方的证人证言、毒品、毒资、称毒所用的天平等物证不易全面收集；有时交易对方素不相识，贩卖成功即分道扬镳，相关人的证据无从获得；贩毒尤其零贩毒次数频繁、时间跨度大，交易双方的语言在时间、地点、数量、具体情节上难以吻合；毒品本身是消耗品，不易缴获，形成证据锁链难。

(5)毒品、毒资追缴难

贩毒者为逃避惩罚，常把交易地点选择在河边、湖边，案发时便将毒品扔水里，被抓获后极力隐瞒毒品的真正来源、用途、去向等，谎称是向不识之人购买，切断了线索，毒品又是直接损耗性消费品，吸毒者吸食、注射后灭失，无从追缴。贩毒属于智能犯罪，毒犯常将毒资转移，对于以贩养吸的，毒资多被用于吸食毒品。

(6)查清全部犯罪事实难

贩毒案件因“中间环节”多，贩毒分子交易时频繁使用假名、假身份，利用知情不多的“马仔”及毫不知情少数贪利之人，许多案件毒品、毒资灭失，难以深入查清全案。目前贩毒分子将大宗毒品化整为零、零星贩卖的情况十分普遍，除当场查获的毒品数量外，对以前贩卖的毒品数量查证难。