在专利技术入股的操作中需要注意如下几方面的问题：1．以专利技术入股有两个重要前提，即其一，此专利已获得国家专利局颁发的专利证书，且仍处于专利有效期内；其二，以专利技术入股的人必须是是专利的合法权利人。

2、专利技术入股的形式，包括以专利所有权入股、以专利实施许可权入股，还有把专利申请权也视为专利技术作价入股。以上三种出资形式都是合法可行的，但实践中对于以后两种方式出资入股的，在一些问题的处理上还存在一定的法律障碍，比如对于专利独占实施许可权的评估作价在实践中不好确定以及出资义务的完成不容易确定等问题，所以，实践中很少采用以后两种方式入股的。在签订出资协议时，最好明确以专利技术入股的形式，为了减少纠纷，首当推以专利所有权入股。

3、在以专利技术入股时，还应当考虑到明确技术资料的交接和权利的移交、专利入股方的技术培训和指导、后续改进成果的权属和各方的违约责任等合同条款。

4、以专利所有权入股需完成以下出资手续方可认定出资无瑕疵，首先须对专利的价值进行评估，专利所有权的评估作价虽无统一的标准，但在实践中可根据技术含量、寿命周期以及周期处于寿命的阶段由专业的评估人士来评估。然后专利权人依据设立公司的合同和章程到专利局办理专利权转移于被投资的公司的登记和公告手续，工商登记机关凭专利权转移的手续确定以专利技术入股的股东的完成股东出资的义务。

5、专利入股需要特别注意专利技术的可靠性。由于审批专利的审查员受专利局文献存储量的限制和工作疏忽等原因，给不具备专利条件的技术授予专利权的可能性是存在的，另外对于实用新型专利和外观设计专利是不进行实质审查的，所以法律规定任何单位和个人都可以提出宣告专利无效的申请。一旦被宣告无效就不具备财产权的属性，就不能作为入股的技术。因此在签订协议前对专利进行必要的审查检索及在合同中约定入股专利被宣告无效后股东之间以及股东与公司之间的关系是非常必要的。6．专利入股出资比例提高。

7、以专利技术入股，不用缴纳营业税。我国的《营业税税目注释》规定，无形资产入股，参与接收投资方的利润分配，共同承担投资风险的行为，不征收营业税。但转让该项股权时，应按营业税的税目征税。

8、以专利技术入股还必须考虑到如何撤资或转让股权的问题。