一、集体土地确权纠纷如何处理

1、运用土地确权原则和方法，确定实践中具体土地权利的类型、性质、主体、客体，以及权利内容等。

2、掌握土地权属争议的类型、现行法律法规和规章中规定的处理方式、处理机关、处理程序；

运用有关土地权属争议调处的规定，对具体争议案件提出处理方式和程序。

3、运用土地确权和争议调处法律、政策，针对具体争议案例进行分析，提出处理意见。各地要从机构建设、队伍建设、经费保障、规范程序等各方面，切实采取有力措施，建立健全土地权属争议调处机制，妥善处理农村集体土地权属争议。《土地管理法》第六十三条土地利用总体规划、城乡规划确定为工业、商业等经营性用途，并经依法登记的集体经营性建设用地，土地所有权人可以通过出让、出租等方式交由单位或者个人使用，并应当签订书面合同，载明土地界址、面积、动工期限、使用期限、土地用途、规划条件和双方其他权利义务。前款规定的集体经营性建设用地出让、出租等，应当经本集体经济组织成员的村民会议三分之二以上成员或者三分之二以上村民代表的同意。通过出让等方式取得的集体经营性建设用地使用权可以转让、互换、出资、赠与或者抵押，但法律、行政法规另有规定或者土地所有权人、土地使用权人签订的书面合同另有约定的除外。集体经营性建设用地的出租，集体建设用地使用权的出让及其最高年限、转让、互换、出资、赠与、抵押等，参照同类用途的国有建设用地执行。具体办法由国务院制定。

二、土地确权纠纷由谁处理

1、个人之间、个人与单位之间、单位与单位之间发生的争议案件，由争议土地所在地的县级国土资源行政主管部门调查处理。

个人之间、个人与单位之间发生的争议案件，可以根据当事人的申请，由乡级人民政府受理和处理。

2、设区的市、自治州国土资源行政主管部门调查处理下列争议案件：

跨县级行政区域的；

同级人民政府、上级国土资源行政主管部门交办或者有关部门转送的。

3、省、自治区、直辖市国土资源行政主管部门调查处理下列争议案件：

跨设区的市、自治州行政区域的；

争议一方为中央国家机关或者其直属单位，且涉及土地面积较大的；

争议一方为军队，且涉及土地面积较大的；

在本行政区域内有较大影响的；

同级人民政府、国土资源部交办或者有关部门转送的。

按照规定集体土地确权如果有什么纠纷的话双方可以协商解决，如果协商不了的话可以申请法院进行诉讼，通过法律的手段维护，现实生活中纠纷是常有的，但总是可以找到解决的办法。