补充协议的效力优于原合同，补充协议不是必须签订的，但一旦签订补充协议，那说明协议内容对合同双方来说是非常重要，且必不可少的。如果补充协议和合同本身条款内容有冲突，补充协议的效力优于合同本身。前面签订的合同代表了当时双方的合意，而之后，双方可以经过协商，改变或增加合同中的部分条款。签订在后的合同表达了目前双方的合意。应该说两份合同都有法律效力，如果内容相互冲突，则后面的合同约定可以推翻前面的合同约定。

一、如何判定补充协议有什么效力

签订合同时的补充协议，可以按新的合同进行处理，如果补充协议符合法律规定的，具有法律效力。

当事人应当按照约定全面履行自己的义务。

当事人应当遵循诚实信用原则，根据合同的性质、目的和交易习惯履行通知、协助、保密等义务。

合同生效后，当事人就质量、价款或者报酬、履行地点等内容没有约定或者约定不明确的，可以协议补充；不能达成补充协议的，按照合同有关条款或者交易习惯确定。

当事人就有关合同内容约定不明确，依照规定仍不能确定的，适用下列规定：

1.质量要求不明确的，按照国家标准、行业标准履行；没有国家标准、行业标准的，按照通常标准或者符合合同目的的特定标准履行。

2.价款或者报酬不明确的，按照订立合同时履行地的市场价格履行；依法应当执行政府定价或者政府指导价的，按照规定履行。

3.履行地点不明确，给付货币的，在接受货币一方所在地履行；交付不动产的，在不动产所在地履行；其他标的，在履行义务一方所在地履行。

4.履行期限不明确的，债务人可以随时履行，债权人也可以随时要求履行，但应当给对方必要的准备时间。

5.履行方式不明确的，按照有利于实现合同目的的方式履行。

6.履行费用的负担不明确的，由履行义务一方负担。

二、补充协议的效力是否及于整个合同

补充协议的效力应及于整个合同。

补充协议是对原合同的补充或者变更，如果补充协议条款与原合同不一致或发生冲突，应当以补充协议为准，但原合同明示不得变更的条款，补充协议中对该条款发生的变更则不发生法律效力。