国家知识产权局《专利审查指南》规定，在申请的实质审查过程中，有下列情形之一的，为了获得更适合的对比文件，审查员应当对申请进行补充检索：

1、申请人修改了权利要求，原先的检索没有覆盖修改后权利要求请求保护的范围；

2、申请人澄清了某些内容，使得原先的检索不完整、不准确；

3、第一次审查意见通知书以前的检索不完整或者不准确；

4、审查意见的改变使得已经作出的检索不完整或者不准确而需要增加或者改变其检索领域的。

在复审后的继续审查过程中，如果出现上述情形，也应当进行补充检索。

此外，对于《专利审查指南》中所述的可能构成抵触申请的指定中国的国际专利申请文件，在对申请发出授予专利权的通知之前，应当通过补充检索查看其是否进入了中国国家阶段并作出了中文公布。

一、实质审查程序中的基本原则

(1)请求原则

除专利法及其实施细则另有规定外，实质审查程序只有在申请人提出实质审查请求的前提下才能启动。审查员只能根据申请人依法正式呈请审查(包括提出申请时、依法提出修改时或者答复审查意见通知书时)的申请文件进行审查。

(2)听证原则

在实质审查过程中，审查员在作出驳回决定之前，应当给申请人提供至少一次针对驳回理由和证据陈述意见和/或修改申请文件的机会，即审查员作出驳回决定时，决定中涉及的驳回理由和所依据的证据应当在之前的审查意见通知书中已经告知过申请人。

(3)节约程序原则

在对发明专利申请进行实质审查时，审查员应当尽可能地缩短审查过程。换言之，审查员要设法尽早地结案。因此，除非确认申请根本没有被授权的前景，审查员应当在第一次审查意见通知书中，将申请中不符合专利法及其实施细则规定的所有问题通知申请人，要求其在指定期限内对所有问题给予答复，尽量地减少与申请人通信的次数，以节约程序。但是，审查员应当注意，不得以节约程序为理由而违反请求原则和听证原则。

二、发明专利实质审查哪些内容

(1)是否符合专利法第五条的规定，即申请专利的主题是否有违反国家法律、社会公德或者妨害公共利益的情况；

(2)是否符合专利法第二十五条的规定，即申请专利的主题是否属于不能授予专利权的范围；

(3)是否符合专利法第三十三条的规定，即专利申请是否符合单一性的要求；

(4)是否符合专利法第三十一条的规定，即申请人对申请进行修改或提出分案申请时，是否超出了原说明书(包括附图)和权利要求书记载的范围；

(5)是否符合专利法及实施细则中规定的发明定义，即对产品、方法或者其改进所提出的新的技术方案。

(6)是否符合专利法实施细则第十八条的规定，即专利申请发明书的撰写是否符合规定的要求并对所要保护的发明作了清楚、完整的说明，使所属技术领域的技术人员能够实现；

(7)是否符合专利法实施细则第二十条的规定，即权利要求书是否清楚和简要地表述了请求保护的范围，权利要求是否以说明书为依据，独立权利要求是否包含了为解决发明所要解决的技术问题的全部必要技术特征。

(8)是否符合在申请要求优先权的情况下，如果发现在优先权日与申请日之间其他人就同一主题提出了另外的专利申请，或者经过检索发现存在此期间公开的相关对被文件时，则审查优先权要求是否成立；同时根据检索出的对比文件判断该发明专利申请的专利性。

发明专利申请自申请日起三年内，国家知识产权局可以根据申请人随时提出的请求，对其申请进行实质审查；申请人无正当理由逾期不请求实质审查的，该申请即被视为撤回。国家知识产权局认为必要的时候，可以自行对发明专利申请进行实质审查。