1。软件著作权登记；2软件著作权保护与侵权认定；三。软件著作权在执行程序中的问题。软件著作权登记、登记机关、登记程序和登记效力、软件登记的立法缺陷目前，中国版权局指定的软件登记主管部门是中国版权保护中心，中华人民共和国新闻出版总署（国家版权局）直属事业单位，成立于1998年9月。中心目前的基本职责是：计算机软件及其他作品的著作权登记、外国音像制品的合同登记、外国音像制品的著作权鉴定、侵权作品鉴定、著作权法律咨询服务等，中国版权保护中心在中国设有机构，即北京市版权局

根据《条例》第七条，“软件著作权人可以向国务院版权行政部门认可的软件登记机关登记。”，计算机软件著作权登记不是强制性的，软件登记的效力也不是绝对的

根据《计算机软件著作权登记办法》中关于软件著作权登记的规定，软件注册应当提供的鉴定材料包括程序和文件的鉴定材料。程序和文件的标识材料应包括源程序和任何类型文件前后连续30页。如果整个程序和文件少于60页，则应提交整个源程序和文件。除特殊情况外，程序每页不得少于50行，文件每页不得少于30行

从以上规定可以看出，我国软件登记机关受理的软件著作权登记没有实际意义。因为未经实质审查，登记机关无法确认申请人出具的软件著作权证书的有效性

软件著作权的法律保护

在发生软件著作权侵权纠纷的情况下，仅对软件界面、目录结构、，菜单结构和软件本身的版权声明不能确定其权利的归属。当双方诉诸法律时，法官一般会要求双方提供软件的源代码进行比对，并委托相关部门进行代码识别。如果一方未能提供可编译的源代码，则该方应承担败诉的不利后果。但是，如果双方都能提供软件的源代码（通常情况下，一方由于工作或合作关系而联系另一方的源代码）。有必要将双方的源代码与软件注册部门保留的文件进行比较。但是，如上所述，软件注册部门保留的源代码很少，根本无法比较。因此，目前，计算机软件侵权案件的认定极为复杂和困难，司法界目前公认的侵权盗版软件的认定方法和步骤是：（1）比较被认定软件与被认定软件的软盘或目录、文件名的内容正版软件。二者完全一致的，可以认为软件侵权人是无手续拥有和使用软件的人或者出卖人；如果不完全一致，而只是大致一致，则应在此基础上执行以下步骤。在比较的过程中，要注意三寸盘和五寸盘的区别。在这种情况下，最好在纸上列出比较的内容，以便于识别