在公司涉及的债权债务关系还在法院诉讼期间，若公司进行注销登记，则无法保证对该案所涉及的债权债务关系进行合理的清算和处理。债权人无法及时依法参与到债权分配中，直接导致债权人的权益难以实现。此外，由于诉讼期间公司被注销登记导致其丧失独立法人资格，即无法作为合法的诉讼主体参与到诉讼中，因此将面临诉讼主体变更问题。此时，该公司的原股东将可能被追加成为案件的当事人，甚至最终承担相应的股东责任。

因此，公司在诉讼过程中不宜进行注销登记，这样既不利于债权人权益的保护，也影响公司的合理清算及股东有限责任的承担。依法合理地进行公司清算，全面彻底地处理公司债权债务后再进行注销登记才是最佳的公司退出市场方式。

通过上面的这些解答，我们可以知道，为了保护各方面的权益、方便后续清算以及股东责任的承担，公司在诉讼过程中，在参与官司时，最好不要进行注销登记。

一、公司在打官司可以注销吗

最好不要。在官司期间建议不要注销公司，这样会导致对方直接起诉你们股东。

根据我国的法律法规，企业在向工商部门提出注销申请时，除了有一定的程序要求外，还要求有企业股东大会决议等实质性要求，其中一项重要的内容就是要有清算报告，对企业的资产、债权债务等作出处理。没有清算报告或者清算报告虚假，就无法办理该企业的工商注销手续，已经办理的手续也没有法律效力。债权人有权要求工商机关撤销企业注销登记。即使工商办理的注销登记不宜撤销（企业的法律人格不存在了），那么企业投资者（即股东）的民事责任并没有免除，债权人可以要求企业的投资者在投资范围内承担民事责任，据此来维护自身的合法权益。

法律依据：

《中华人民共和国公司法》第一百八十六条

清算组在清理公司财产、编制资产负债表和财产清单后，应当制定清算方案，并报股东会、股东大会或者人民法院确认。

公司财产在分别支付清算费用、职工的工资、社会保险费用和法定补偿金，缴纳所欠税款，清偿公司债务后的剩余财产，有限责任公司按照股东的出资比例分配，股份有限公司按照股东持有的股份比例分配。

清算期间，公司存续，但不得开展与清算无关的经营活动。公司财产在未依照前款规定清偿前，不得分配给股东。